27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31440 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31440  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  897    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4292  hypothetical protein  39.04 
 
 		 548 aa  106  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0985471  normal  0.375919 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09880  hypothetical protein  28.14 
 
 		 527 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1339  hypothetical protein  25.82 
 
 		 454 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.487652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4031  hypothetical protein  35.96 
 
 		 475 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3824  hypothetical protein  32.24 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1431  hypothetical protein  31.07 
 
 		 463 aa  67  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.196481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3971  hypothetical protein  35.54 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.653206 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21480  hypothetical protein  38.37 
 
 		 89 aa  65.1  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.021145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21460  hypothetical protein  38.37 
 
 		 89 aa  65.1  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00301296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8746  hypothetical protein  31.87 
 
 		 795 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0708  hypothetical protein  30.58 
 
 		 535 aa  63.2  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.221835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0293  hypothetical protein  48.1 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.338259  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1982  alpha/beta hydrolase  36.27 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13240  hypothetical protein  37.17 
 
 		 361 aa  53.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370399  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03140  hypothetical protein  39.73 
 
 		 179 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03800  hypothetical protein  37.23 
 
 		 372 aa  50.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3506  hypothetical protein  31.09 
 
 		 526 aa  50.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143651 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20130  hypothetical protein  41.94 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1405  hypothetical protein  29.1 
 
 		 540 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0803  hypothetical protein  36.17 
 
 		 336 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3987  hypothetical protein  29.27 
 
 		 498 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4427  hypothetical protein  35.79 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  34 
 
 		 1959 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1142  hypothetical protein  31.76 
 
 		 91 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0668066  hitchhiker  0.0000468603 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3409  hypothetical protein  28.83 
 
 		 520 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3784  hypothetical protein  29.09 
 
 		 553 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>