17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1431 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1431  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  906    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.196481  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1405  hypothetical protein  33.51 
 
 
540 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116311  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8746  hypothetical protein  30.16 
 
 
795 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0708  hypothetical protein  36.36 
 
 
535 aa  82.4  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.221835 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3824  hypothetical protein  32.84 
 
 
456 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4292  hypothetical protein  32.79 
 
 
548 aa  72.4  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0985471  normal  0.375919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1339  hypothetical protein  31.64 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.487652  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3971  hypothetical protein  28.24 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.653206 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31440  hypothetical protein  30.51 
 
 
451 aa  67  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1982  alpha/beta hydrolase  33.55 
 
 
433 aa  66.6  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0293  hypothetical protein  32.02 
 
 
479 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.338259  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20130  hypothetical protein  33.56 
 
 
510 aa  53.9  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09880  hypothetical protein  29.17 
 
 
527 aa  53.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4031  hypothetical protein  31.41 
 
 
475 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3409  hypothetical protein  30.6 
 
 
520 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3226  hypothetical protein  26.43 
 
 
523 aa  43.1  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 
284 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>