18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4292 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4292  hypothetical protein  100 
 
 		 548 aa  1009    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0985471  normal  0.375919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3971  hypothetical protein  40.09 
 
 		 447 aa  137  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.653206 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31440  hypothetical protein  38.17 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0293  hypothetical protein  38.57 
 
 		 479 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.338259  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0708  hypothetical protein  33.71 
 
 		 535 aa  101  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.221835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4031  hypothetical protein  36.96 
 
 		 475 aa  90.9  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3824  hypothetical protein  34.5 
 
 		 456 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1982  alpha/beta hydrolase  39.16 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3409  hypothetical protein  38.52 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1339  hypothetical protein  37.08 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.487652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1431  hypothetical protein  32.79 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.196481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8746  hypothetical protein  32.64 
 
 		 795 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3226  hypothetical protein  41.29 
 
 		 523 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1405  hypothetical protein  32.29 
 
 		 540 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09880  hypothetical protein  37.93 
 
 		 527 aa  64.7  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2474  hypothetical protein  31.51 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22339  normal  0.0679408 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20130  hypothetical protein  33.09 
 
 		 510 aa  53.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0803  hypothetical protein  27.14 
 
 		 336 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>