18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0708 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0708  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1107    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.221835 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1982  alpha/beta hydrolase  47.13 
 
 		 433 aa  281  3e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4292  hypothetical protein  33.71 
 
 		 548 aa  89.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0985471  normal  0.375919 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1431  hypothetical protein  36.36 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.196481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3971  hypothetical protein  33.81 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.653206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0293  hypothetical protein  31.79 
 
 		 479 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.338259  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3409  hypothetical protein  38.85 
 
 		 520 aa  75.1  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3226  hypothetical protein  32.68 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3824  hypothetical protein  33.57 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1405  hypothetical protein  27.11 
 
 		 540 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8746  hypothetical protein  30.08 
 
 		 795 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31440  hypothetical protein  30.58 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4031  hypothetical protein  31.69 
 
 		 475 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1339  hypothetical protein  30.67 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.487652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2474  hypothetical protein  29.82 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22339  normal  0.0679408 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20130  hypothetical protein  25.71 
 
 		 510 aa  50.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09880  hypothetical protein  30.83 
 
 		 527 aa  47.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0803  hypothetical protein  33.63 
 
 		 336 aa  43.5  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>