16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8746 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8746  hypothetical protein  100 
 
 		 795 aa  1551    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1405  hypothetical protein  39.69 
 
 		 540 aa  308  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5605  hypothetical protein  60.15 
 
 		 299 aa  147  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1431  hypothetical protein  34.12 
 
 		 463 aa  92.4  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.196481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1339  hypothetical protein  37.29 
 
 		 454 aa  77  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.487652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0708  hypothetical protein  30.08 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.221835 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3824  hypothetical protein  30.28 
 
 		 456 aa  63.9  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4292  hypothetical protein  32.64 
 
 		 548 aa  61.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0985471  normal  0.375919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4031  hypothetical protein  30.52 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1982  alpha/beta hydrolase  33.8 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31440  hypothetical protein  33.6 
 
 		 451 aa  56.2  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3971  hypothetical protein  32.06 
 
 		 447 aa  55.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.653206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1252  hypothetical protein  30.3 
 
 		 318 aa  55.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09880  hypothetical protein  36.67 
 
 		 527 aa  51.6  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20130  hypothetical protein  32.14 
 
 		 510 aa  45.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  42.47 
 
 		 848 aa  44.3  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>