26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1335 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1335  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  176  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.362868  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1297  hypothetical protein  40.23 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4101  hypothetical protein  40.23 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3875  hypothetical protein  41.86 
 
 
87 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0804  hypothetical protein  45.35 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0495  hypothetical protein  42.17 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0118149  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0803  hypothetical protein  38.2 
 
 
336 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1145  hypothetical protein  41.94 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0361475  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21510  hypothetical protein  35.29 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1336  hypothetical protein  36.9 
 
 
307 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.382211  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09880  hypothetical protein  39.29 
 
 
527 aa  53.9  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21460  hypothetical protein  32.18 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00301296  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21480  hypothetical protein  32.18 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.021145  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3987  hypothetical protein  32.1 
 
 
498 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3506  hypothetical protein  31.33 
 
 
526 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1467  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1323  hypothetical protein  33.72 
 
 
379 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204779  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4427  hypothetical protein  35.23 
 
 
454 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0494  hypothetical protein  29.49 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0346599  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21470  hypothetical protein  30.95 
 
 
106 aa  44.7  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00182036  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21490  hypothetical protein  30.95 
 
 
106 aa  44.7  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0219247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3784  hypothetical protein  30.68 
 
 
553 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13240  hypothetical protein  31.4 
 
 
361 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370399  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31440  hypothetical protein  32.56 
 
 
451 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3766  hypothetical protein  27.16 
 
 
494 aa  42  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1153  hypothetical protein  32.93 
 
 
310 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  decreased coverage  0.0000174262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>