12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5150 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5150  hypothetical protein  100 
 
 		 634 aa  1306    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0397106  normal  0.0961186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3987  hypothetical protein  40.86 
 
 		 498 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3766  hypothetical protein  40.41 
 
 		 494 aa  224  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4427  hypothetical protein  35.87 
 
 		 454 aa  187  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4372  hypothetical protein  33.87 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.73 
 
 		 1489 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  30.09 
 
 		 1528 aa  47.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  30.09 
 
 		 1518 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5394  hypothetical protein  24.69 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  30.09 
 
 		 1495 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  29.2 
 
 		 1528 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  29.2 
 
 		 1508 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>