35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0405 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  100 
 
 		 469 aa  957    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  55.44 
 
 		 557 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  35.35 
 
 		 569 aa  169  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  39.7 
 
 		 562 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  33.73 
 
 		 320 aa  154  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  31.23 
 
 		 545 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  29.04 
 
 		 563 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  28.15 
 
 		 525 aa  120  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  30.74 
 
 		 368 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  29.77 
 
 		 619 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  29.22 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  29.68 
 
 		 507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  30.64 
 
 		 590 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  30.91 
 
 		 516 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  36.52 
 
 		 403 aa  106  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  30.15 
 
 		 609 aa  106  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  30.16 
 
 		 615 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  30.16 
 
 		 615 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  30.3 
 
 		 554 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  27.71 
 
 		 561 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  30.16 
 
 		 615 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  29.68 
 
 		 627 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  29.08 
 
 		 656 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  27.3 
 
 		 554 aa  99.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  28.86 
 
 		 594 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  29.44 
 
 		 556 aa  97.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  28.92 
 
 		 501 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  28.41 
 
 		 654 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  32.99 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  26.19 
 
 		 507 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  23.96 
 
 		 526 aa  61.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  27.08 
 
 		 547 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  26.32 
 
 		 393 aa  47.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  25.61 
 
 		 538 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  42.22 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>