43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0260 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  100 
 
 		 554 aa  1110    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  43.8 
 
 		 533 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  38.48 
 
 		 525 aa  229  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  37.89 
 
 		 556 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  37.94 
 
 		 554 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  33.85 
 
 		 516 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  37.5 
 
 		 594 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 545 aa  180  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  34.19 
 
 		 590 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  32.79 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  33.52 
 
 		 609 aa  169  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  33.5 
 
 		 619 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  34.21 
 
 		 501 aa  160  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  33.15 
 
 		 507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  33.42 
 
 		 627 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  32.12 
 
 		 615 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  32.12 
 
 		 615 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  32.12 
 
 		 615 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  30.46 
 
 		 656 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  29.63 
 
 		 654 aa  134  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  28.5 
 
 		 563 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  28.91 
 
 		 526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  31.42 
 
 		 320 aa  113  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  29.25 
 
 		 569 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  29.24 
 
 		 557 aa  104  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  27.3 
 
 		 469 aa  103  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  32.39 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  30.68 
 
 		 561 aa  100  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5421  hypothetical protein  28 
 
 		 871 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.376611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  29.91 
 
 		 507 aa  87.8  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  28.93 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  31.34 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  30.77 
 
 		 547 aa  71.6  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  29.77 
 
 		 562 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  26.5 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  29.82 
 
 		 538 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  30.12 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  31.77 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3457  hypothetical protein  26.84 
 
 		 842 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  25.26 
 
 		 588 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  28.49 
 
 		 564 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  31.33 
 
 		 339 aa  50.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4851  hypothetical protein  31.23 
 
 		 473 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>