36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0604 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  100 
 
 		 507 aa  969    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  30.08 
 
 		 507 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  32.3 
 
 		 563 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  28.54 
 
 		 501 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  30.65 
 
 		 516 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  33.33 
 
 		 615 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  33.33 
 
 		 615 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 615 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  27.08 
 
 		 594 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  29.51 
 
 		 533 aa  109  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  31.75 
 
 		 590 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  32.14 
 
 		 609 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  31.58 
 
 		 554 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  31.34 
 
 		 556 aa  103  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  31 
 
 		 526 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  32.17 
 
 		 656 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  29.03 
 
 		 554 aa  100  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  30.75 
 
 		 569 aa  100  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  26.7 
 
 		 545 aa  96.7  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  29.35 
 
 		 368 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  29.07 
 
 		 627 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  27.55 
 
 		 469 aa  92.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  28.97 
 
 		 619 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  28.57 
 
 		 525 aa  88.6  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  34.36 
 
 		 654 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  28.78 
 
 		 561 aa  84.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  32.08 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  29.92 
 
 		 320 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  36.46 
 
 		 562 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  29.93 
 
 		 403 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  24.68 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  30.09 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  29.55 
 
 		 547 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  35.37 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  30.46 
 
 		 246 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  27.61 
 
 		 355 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>