36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3243 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  50 
 
 		 355 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  45.74 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  51.58 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  40 
 
 		 339 aa  95.9  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  35.29 
 
 		 556 aa  91.7  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  33.62 
 
 		 545 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  31.1 
 
 		 533 aa  89  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  32.63 
 
 		 590 aa  86.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  32.55 
 
 		 619 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  31.25 
 
 		 507 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  30.23 
 
 		 501 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  32.64 
 
 		 609 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  32.5 
 
 		 554 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  31.67 
 
 		 654 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  31.28 
 
 		 656 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  32.49 
 
 		 516 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  30.74 
 
 		 627 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  29.27 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  28.91 
 
 		 563 aa  72  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  29.54 
 
 		 525 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  32.23 
 
 		 615 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  32.23 
 
 		 615 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  26.5 
 
 		 554 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  31.4 
 
 		 615 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  27.66 
 
 		 526 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  34.44 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  31.67 
 
 		 594 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  35.39 
 
 		 393 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  30.34 
 
 		 569 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  30.3 
 
 		 561 aa  55.8  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  32.21 
 
 		 403 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  28.65 
 
 		 562 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  29.83 
 
 		 547 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  27.93 
 
 		 557 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  28 
 
 		 469 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>