39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12562 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  801    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  44.93 
 
 		 562 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  36.45 
 
 		 557 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  36.52 
 
 		 469 aa  106  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  31.85 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  32.09 
 
 		 569 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  32.68 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  32.28 
 
 		 609 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  31.61 
 
 		 619 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  31.3 
 
 		 554 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  28.85 
 
 		 563 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  28.8 
 
 		 526 aa  69.7  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  32.14 
 
 		 533 aa  69.3  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  31.42 
 
 		 501 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  31.93 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  37.5 
 
 		 507 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  32.35 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  30.12 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 545 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  32.35 
 
 		 615 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  32.35 
 
 		 615 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  27.59 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  30.32 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  27.36 
 
 		 525 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  30.64 
 
 		 516 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  29.38 
 
 		 656 aa  57  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  30.99 
 
 		 280 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  30.6 
 
 		 355 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  32.29 
 
 		 246 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  26.5 
 
 		 561 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  30.95 
 
 		 654 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4851  hypothetical protein  29.26 
 
 		 473 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  32.67 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  27.42 
 
 		 594 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  29.2 
 
 		 507 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1972  hypothetical protein  37.18 
 
 		 653 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0816765  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  23.56 
 
 		 627 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11978  hypothetical protein  34.43 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12112  transmembrane protein  41.67 
 
 		 323 aa  44.3  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.16794e-24  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>