39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4801 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  100 
 
 
526 aa  1066    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  30.54 
 
 
525 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  29.09 
 
 
533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  30.15 
 
 
545 aa  180  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  34.08 
 
 
368 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  34.15 
 
 
556 aa  170  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  33.15 
 
 
554 aa  169  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  27.79 
 
 
594 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  30.85 
 
 
590 aa  134  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  31.38 
 
 
609 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  26.33 
 
 
501 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  25.88 
 
 
507 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  29.2 
 
 
554 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  28.5 
 
 
563 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  30.06 
 
 
516 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  27.59 
 
 
619 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  28.1 
 
 
569 aa  100  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  30.03 
 
 
507 aa  93.2  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  27.46 
 
 
656 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  31.06 
 
 
654 aa  91.3  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  28.8 
 
 
561 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  28.16 
 
 
320 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  28.51 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  25.45 
 
 
615 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  25.45 
 
 
615 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  24.94 
 
 
615 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  30.1 
 
 
562 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  26.9 
 
 
588 aa  69.7  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  28.8 
 
 
403 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  28.34 
 
 
393 aa  69.7  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  24 
 
 
627 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  30.16 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  28.53 
 
 
538 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  28.84 
 
 
564 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  27.66 
 
 
246 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  23.96 
 
 
469 aa  61.6  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  25.46 
 
 
557 aa  55.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  29.65 
 
 
234 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4851  hypothetical protein  28.11 
 
 
473 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>