33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3447 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  100 
 
 
538 aa  1041    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  71.37 
 
 
564 aa  657    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  32.87 
 
 
588 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4851  hypothetical protein  40 
 
 
473 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  30.5 
 
 
501 aa  93.6  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  29.54 
 
 
569 aa  77  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  26.58 
 
 
533 aa  76.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  25.76 
 
 
627 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  27.9 
 
 
507 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  30.33 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  31.27 
 
 
609 aa  71.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  27.23 
 
 
545 aa  68.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  31.01 
 
 
590 aa  67  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  28.53 
 
 
526 aa  67  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  26.26 
 
 
525 aa  67  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  28.61 
 
 
554 aa  64.7  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  25.48 
 
 
563 aa  63.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  29.37 
 
 
656 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  31.63 
 
 
393 aa  61.2  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  24.66 
 
 
561 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  26.97 
 
 
594 aa  57.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  24.2 
 
 
619 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  29.72 
 
 
368 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  32.32 
 
 
654 aa  53.9  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  26.76 
 
 
615 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  26.53 
 
 
615 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  26.53 
 
 
615 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  24.67 
 
 
554 aa  47.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0088  hypothetical protein  33.66 
 
 
470 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.210436  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  25.06 
 
 
556 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  25.61 
 
 
469 aa  44.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  29.69 
 
 
280 aa  44.3  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  31.74 
 
 
355 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>