26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2022 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  100 
 
 		 588 aa  1190    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  32.17 
 
 		 564 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  32.11 
 
 		 538 aa  187  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  26.2 
 
 		 501 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  25.43 
 
 		 594 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  24.51 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  25.87 
 
 		 533 aa  77.4  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4851  hypothetical protein  31.99 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  24.31 
 
 		 554 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  23.13 
 
 		 525 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  24.77 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  26.8 
 
 		 526 aa  68.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  26.33 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  25.85 
 
 		 590 aa  63.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  24.62 
 
 		 615 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  26.3 
 
 		 609 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  23.6 
 
 		 556 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  24.62 
 
 		 615 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  24.62 
 
 		 615 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  28 
 
 		 545 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  27.74 
 
 		 441 aa  60.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  25.26 
 
 		 554 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  24.87 
 
 		 619 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  25.91 
 
 		 516 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  26.74 
 
 		 561 aa  45.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  23.56 
 
 		 627 aa  43.9  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124758 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>