37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2415 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  100 
 
 
557 aa  1117    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  55.44 
 
 
469 aa  481  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  33.25 
 
 
569 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  36.56 
 
 
562 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  34.05 
 
 
320 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  28.93 
 
 
507 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  33.43 
 
 
615 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  29.58 
 
 
525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  36.45 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  33.14 
 
 
615 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  33.14 
 
 
615 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  27.73 
 
 
516 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  29.65 
 
 
545 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  29.02 
 
 
501 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  30.29 
 
 
627 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  28.62 
 
 
554 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  29.29 
 
 
533 aa  103  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  29.41 
 
 
654 aa  100  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  26.3 
 
 
656 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  30.88 
 
 
368 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  27.52 
 
 
563 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  31.16 
 
 
590 aa  91.3  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  31.93 
 
 
609 aa  90.9  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  27.62 
 
 
556 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  26.17 
 
 
554 aa  84.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  26.52 
 
 
619 aa  80.1  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  25.76 
 
 
561 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  27.25 
 
 
594 aa  72.8  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  31.71 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  35.91 
 
 
393 aa  57.4  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  25.46 
 
 
526 aa  54.7  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  28.49 
 
 
355 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  23.57 
 
 
507 aa  48.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  32.85 
 
 
234 aa  47.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4851  hypothetical protein  25.73 
 
 
473 aa  44.3  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  27.93 
 
 
246 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  29.41 
 
 
547 aa  43.9  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>