32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3329 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  100 
 
 		 339 aa  646    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  40.28 
 
 		 246 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  36.21 
 
 		 355 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  34.63 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  42.58 
 
 		 234 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  30.53 
 
 		 563 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  31.63 
 
 		 554 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  30.13 
 
 		 516 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  36.6 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  29.92 
 
 		 561 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  32.48 
 
 		 594 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  28.98 
 
 		 615 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  30.93 
 
 		 590 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  32.57 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  31.63 
 
 		 556 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  28.98 
 
 		 615 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  28.98 
 
 		 615 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  29.63 
 
 		 627 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  33.02 
 
 		 562 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  35.12 
 
 		 547 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  27.43 
 
 		 554 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4851  hypothetical protein  33.02 
 
 		 473 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  27.88 
 
 		 545 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  31.91 
 
 		 654 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  32.67 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  32.39 
 
 		 609 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  28.33 
 
 		 533 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  27.24 
 
 		 619 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  32.43 
 
 		 569 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  30.87 
 
 		 501 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  33.18 
 
 		 564 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0962  hypothetical protein  36.96 
 
 		 250 aa  42.7  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000273165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>