40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1126 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 733 aa  1513    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  47.78 
 
 		 459 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  49.17 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  48.57 
 
 		 555 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  46.49 
 
 		 556 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  45.81 
 
 		 441 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  44.71 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  45.45 
 
 		 432 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  46.21 
 
 		 420 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  39.82 
 
 		 457 aa  355  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  42.07 
 
 		 424 aa  346  8e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  43.29 
 
 		 429 aa  320  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  30.89 
 
 		 474 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  30.47 
 
 		 503 aa  201  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  30.71 
 
 		 505 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  29.58 
 
 		 450 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  27.91 
 
 		 534 aa  183  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  29.77 
 
 		 929 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  27.31 
 
 		 525 aa  181  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  29.61 
 
 		 432 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.9 
 
 		 1967 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  29.39 
 
 		 444 aa  162  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  28.05 
 
 		 466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  29.65 
 
 		 443 aa  157  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  25.82 
 
 		 560 aa  157  7e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  29.39 
 
 		 444 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  26.2 
 
 		 561 aa  154  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  26.65 
 
 		 427 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  25.06 
 
 		 423 aa  137  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  27.03 
 
 		 437 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  24.77 
 
 		 396 aa  133  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  27.91 
 
 		 439 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  24.88 
 
 		 412 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0196  fibronectin, type III  31.82 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.57 
 
 		 6885 aa  51.2  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  22.61 
 
 		 2716 aa  49.3  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  30 
 
 		 970 aa  48.1  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  28.08 
 
 		 3802 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  31.39 
 
 		 1973 aa  45.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  21.14 
 
 		 2927 aa  44.3  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>