76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2659 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 389 aa  762    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1557  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  81.36 
 
 		 390 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1821  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.103066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0979  TPR repeat-containing protein  42.7 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0547442  normal  0.0871069 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2024  hypothetical protein  34.51 
 
 		 373 aa  189  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1593  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.63 
 
 		 320 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2026  tetratricopeptide TPR_4  37.36 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2131  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.28 
 
 		 1764 aa  57.4  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0043  TPR domain-containing protein  35 
 
 		 627 aa  53.9  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3930  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 974 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 968 aa  50.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  29.6 
 
 		 1014 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0942  tetratricopeptide TPR_4  31.36 
 
 		 765 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.799869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4485  transcriptional regulator, CadC  35.23 
 
 		 520 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0669  hypothetical protein  36.11 
 
 		 498 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.757519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 2262 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  40.26 
 
 		 1450 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 522 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  25.59 
 
 		 632 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 878 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 613 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 1112 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 643 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 357 aa  46.6  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.1 
 
 		 810 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 739 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 522 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 279 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3954  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 970 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3867  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 967 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  34.74 
 
 		 933 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 750 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 3172 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.1 
 
 		 639 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.32 
 
 		 265 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 		 632 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0237  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.45 
 
 		 984 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 		 2240 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  27.66 
 
 		 615 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  30.08 
 
 		 559 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3810  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 969 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.324215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 632 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  25.74 
 
 		 676 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.31 
 
 		 624 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.63 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.52 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  23.66 
 
 		 661 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 2262 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 789 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 800 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 688 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  29.19 
 
 		 601 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  29.76 
 
 		 577 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 673 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 573 aa  43.9  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  29.76 
 
 		 577 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 265 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1898  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 458 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  32.53 
 
 		 729 aa  43.5  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 357 aa  43.5  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 828 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  30.47 
 
 		 725 aa  43.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 952 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0415  TPR domain-containing protein  32.06 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  34.25 
 
 		 563 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 363 aa  43.1  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0939  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.06 
 
 		 753 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 900 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.04 
 
 		 571 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00051  Flp pilus assembly protein TadD  32.47 
 
 		 297 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 337 aa  42.7  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>