More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3395 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3395  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 652 aa  1245    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105857  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 878 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.09 
 
 		 810 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 909 aa  103  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.36 
 
 		 632 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 681 aa  94  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 3145 aa  91.3  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 2262 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 3035 aa  88.6  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 685 aa  86.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 620 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.38 
 
 		 818 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.38 
 
 		 784 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25 
 
 		 795 aa  84.7  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 808 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.83 
 
 		 816 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 847 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 3172 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.72 
 
 		 988 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 2262 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.37 
 
 		 750 aa  78.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 4489 aa  78.6  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 1297 aa  78.2  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25 
 
 		 725 aa  78.2  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1676 aa  77.8  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.69 
 
 		 1022 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.02 
 
 		 620 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 718 aa  78.2  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.22 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.17 
 
 		 626 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.55 
 
 		 626 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 968 aa  76.6  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.25 
 
 		 887 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.25 
 
 		 1979 aa  75.1  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.24 
 
 		 626 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.07 
 
 		 1056 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.24 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.24 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.02 
 
 		 597 aa  73.9  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 827 aa  73.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 789 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  25 
 
 		 1077 aa  73.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 637 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  25.35 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  37.75 
 
 		 1005 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  25.74 
 
 		 865 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 739 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 614 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 		 2240 aa  70.9  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.81 
 
 		 837 aa  70.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.32 
 
 		 1056 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.46 
 
 		 3301 aa  70.5  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.32 
 
 		 689 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 3560 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 750 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 573 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  25.63 
 
 		 714 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  20.49 
 
 		 681 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 602 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 615 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.02 
 
 		 622 aa  68.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.19 
 
 		 561 aa  68.2  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 955 aa  67.8  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.05 
 
 		 557 aa  67.8  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 935 aa  67.8  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  20.5 
 
 		 905 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.4 
 
 		 340 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 405 aa  66.6  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.98 
 
 		 875 aa  67  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.27 
 
 		 1154 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.6 
 
 		 1694 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 1276 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  21.23 
 
 		 1421 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.85 
 
 		 561 aa  65.9  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.15 
 
 		 1764 aa  65.9  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 1406 aa  65.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 601 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1094 aa  65.1  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 4079 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 754 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.24 
 
 		 639 aa  63.9  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  24.52 
 
 		 603 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 639 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 399 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 828 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  24.07 
 
 		 587 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.54 
 
 		 1034 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 767 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 288 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>