66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0530 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 314 aa  627  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  45.77 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  39.67 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  42.32 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  44.2 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  43.02 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  43.24 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  40.65 
 
 		 332 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  42.01 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  43.11 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  40.37 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  41.32 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  36.71 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  32.65 
 
 		 322 aa  155  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  31.88 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  36.28 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  36.84 
 
 		 244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  36.36 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  34.45 
 
 		 231 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3246  hypothetical protein  35.86 
 
 		 244 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310754  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  38.36 
 
 		 172 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  33.66 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  34.47 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  33.71 
 
 		 188 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  35.19 
 
 		 223 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  26.03 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2117  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.1 
 
 		 207 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0719  peptidase C39 bacteriocin processing  28.87 
 
 		 164 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  29.9 
 
 		 444 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1103  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.04 
 
 		 189 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0923259 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0551  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 188 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0299  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 188 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1902  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 188 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0636  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 159 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.435479  normal  0.935135 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  24.75 
 
 		 875 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 792 aa  45.8  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 351 aa  45.8  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 217 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  33.04 
 
 		 648 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  30.21 
 
 		 587 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 186 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1186  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1197 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  30.21 
 
 		 545 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 502 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1197  fimbrial biogenesis and twitching motility protein  31.17 
 
 		 179 aa  43.9  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  29.66 
 
 		 502 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 		 1252 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 		 1252 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  43.14 
 
 		 638 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 593 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 502 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  28.26 
 
 		 1213 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  25.58 
 
 		 897 aa  43.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  29.59 
 
 		 420 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  29.59 
 
 		 420 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1303  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.83 
 
 		 266 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682058  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 494 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  29.59 
 
 		 420 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  29.59 
 
 		 420 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 420 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 420 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  29.59 
 
 		 420 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  29.59 
 
 		 420 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  29.59 
 
 		 420 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>