269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2492 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2492  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
441 aa  892    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.64 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.3 
 
 
725 aa  76.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 
878 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.5 
 
 
810 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 
714 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 
3145 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.95 
 
 
875 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
909 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  39 
 
 
685 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  28.98 
 
 
594 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 
3560 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.39 
 
 
816 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.29 
 
 
865 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 
649 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  24.54 
 
 
577 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.42 
 
 
732 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  24.54 
 
 
577 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.25 
 
 
632 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 
637 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 
4079 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3465  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.88 
 
 
451 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0563364  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  24.91 
 
 
714 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  39 
 
 
681 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.44 
 
 
1056 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
750 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
612 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
362 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3401  Tetratricopeptide TPR_4  27.51 
 
 
453 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0349174  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  23.39 
 
 
1252 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  34.11 
 
 
603 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  23.39 
 
 
1252 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
1827 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.73 
 
 
795 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.9 
 
 
988 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
3035 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3321  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 
740 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 
750 aa  57  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
739 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.68 
 
 
733 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
356 aa  57  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  28.57 
 
 
269 aa  57  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  23 
 
 
392 aa  57  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1518  TPR domain-containing protein  33.02 
 
 
258 aa  56.6  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 
601 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 
1094 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  30.61 
 
 
779 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
883 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  33.93 
 
 
267 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
247 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  33.33 
 
 
430 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.06 
 
 
820 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.3 
 
 
1022 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  25.45 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 
217 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  25.17 
 
 
725 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 
847 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  23.53 
 
 
561 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
583 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 
4489 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
718 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  38.39 
 
 
529 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 
237 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 
602 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
323 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  23.16 
 
 
561 aa  53.5  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  22.67 
 
 
708 aa  53.1  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  30 
 
 
566 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  25.48 
 
 
750 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02118  tetratricopeptide repeat protein  24.51 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000128021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
291 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 
301 aa  53.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  30.56 
 
 
299 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 
955 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  28.95 
 
 
425 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
315 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 
792 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3385  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 
427 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.981404  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
542 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2185  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.53 
 
 
285 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
808 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 
465 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 
288 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.3 
 
 
250 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58946e-23 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.76 
 
 
174 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
615 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.37 
 
 
594 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.22 
 
 
887 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25.64 
 
 
314 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
292 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.95 
 
 
571 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1658  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
250 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
395 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  26.3 
 
 
936 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.38 
 
 
1694 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  31.03 
 
 
864 aa  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1870  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.52 
 
 
268 aa  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 
1276 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
711 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>