100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0636 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0636  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 159 aa  320  7e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.435479  normal  0.935135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1103  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  62.69 
 
 		 189 aa  164  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0923259 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0957  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000843973  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.87 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0733  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  35.34 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1309  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  27.97 
 
 		 252 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 362 aa  51.2  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1432  type IV pilus biogenesis protein PilF  28.97 
 
 		 252 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  34.69 
 
 		 603 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  38.39 
 
 		 1106 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 593 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14850  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  28.67 
 
 		 252 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1246  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 252 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.619631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2108  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 258 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 681 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4603  Type IV pilus biogenesis protein PilF  30.84 
 
 		 252 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1288  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.46 
 
 		 262 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  32.71 
 
 		 314 aa  48.5  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2309  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 278 aa  48.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40310  type IV pilus biogenesis protein PilF  30.99 
 
 		 252 aa  48.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  30.19 
 
 		 677 aa  48.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 685 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4040  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 226 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  30.3 
 
 		 1213 aa  47.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1658  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.41 
 
 		 261 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  31.48 
 
 		 594 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  38.26 
 
 		 776 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1542  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.34 
 
 		 262 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.364125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 1106 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 606 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 637 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 811 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2367  fimbrial biogenesis and twitching motility protein, putative  25.87 
 
 		 262 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000700104  normal  0.549255 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 		 587 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 686 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 612 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 3145 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  38.32 
 
 		 575 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2297  TPR domain-containing protein  32.98 
 
 		 226 aa  44.3  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  29.37 
 
 		 621 aa  44.3  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  29.37 
 
 		 621 aa  44.3  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2185  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  34.44 
 
 		 285 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  34.62 
 
 		 425 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.15 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 878 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 602 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 601 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.56 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.31 
 
 		 810 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 566 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0881  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.1 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904873  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 		 804 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 399 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1303  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.62 
 
 		 266 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682058  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 708 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 573 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  37.72 
 
 		 482 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 748 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1256  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  33.73 
 
 		 261 aa  43.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 311 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1217  putative fimbrial biogenesis and twitching motility protein  29.6 
 
 		 237 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.544829  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 502 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  33.33 
 
 		 795 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3871  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 196 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 909 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1430  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.03 
 
 		 262 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.14258  normal  0.202712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 2262 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.54 
 
 		 249 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 643 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 572 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  41.79 
 
 		 566 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2046  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.48 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.278718  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 472 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.54 
 
 		 249 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  45.33 
 
 		 905 aa  41.6  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0851  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.36 
 
 		 255 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 		 673 aa  41.6  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  32.74 
 
 		 542 aa  41.6  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.95 
 
 		 610 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 860 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0420  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.3 
 
 		 249 aa  41.2  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1291  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.3 
 
 		 249 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3150  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.36 
 
 		 262 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0633925  hitchhiker  0.00734203 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2992  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.36 
 
 		 262 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00509234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3007  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.36 
 
 		 262 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000355185  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1184  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.3 
 
 		 249 aa  41.2  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  38.67 
 
 		 952 aa  41.2  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 686 aa  40.8  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3385  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 427 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.981404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.38 
 
 		 634 aa  40.8  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 610 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 621 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  42.62 
 
 		 642 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 		 576 aa  40.4  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.69 
 
 		 875 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.13 
 
 		 725 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1114  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  23.57 
 
 		 261 aa  40.8  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3392  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.99 
 
 		 266 aa  40.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>