79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0687 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  68.25 
 
 
1313 aa  1446    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  99.87 
 
 
1574 aa  2988    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  94.81 
 
 
1544 aa  2226    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  70.04 
 
 
1297 aa  1538    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  98.29 
 
 
1574 aa  2352    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  69.37 
 
 
1315 aa  1488    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  100 
 
 
1580 aa  2999    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  70.04 
 
 
1297 aa  1538    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  43.08 
 
 
1267 aa  910    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  84.54 
 
 
1471 aa  1937    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  68.81 
 
 
1259 aa  1518    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  95.07 
 
 
1548 aa  2235    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  70.2 
 
 
1297 aa  1546    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  42.61 
 
 
1265 aa  868    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  99.53 
 
 
1266 aa  2033    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  69.65 
 
 
1315 aa  1518    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  31.38 
 
 
1157 aa  246  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  31.66 
 
 
1140 aa  244  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  31.79 
 
 
1157 aa  243  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  31.66 
 
 
1157 aa  243  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  31.66 
 
 
1157 aa  243  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  31.66 
 
 
1157 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  31.66 
 
 
1157 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  26.1 
 
 
1271 aa  242  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  34.69 
 
 
1157 aa  231  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  29.73 
 
 
1160 aa  223  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  29.51 
 
 
1150 aa  219  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  30.55 
 
 
1180 aa  218  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  30.55 
 
 
1172 aa  217  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  30.55 
 
 
1180 aa  217  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  30.42 
 
 
1150 aa  216  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  32.23 
 
 
1159 aa  214  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  34.95 
 
 
1542 aa  214  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  31.34 
 
 
1164 aa  206  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  27.61 
 
 
1186 aa  204  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  35.07 
 
 
1244 aa  193  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  33.16 
 
 
1569 aa  193  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  32.91 
 
 
1588 aa  190  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  41.03 
 
 
289 aa  186  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  28.55 
 
 
1172 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  30.13 
 
 
1172 aa  172  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  27.46 
 
 
1230 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  31.47 
 
 
1331 aa  147  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  26.76 
 
 
1324 aa  139  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  27.09 
 
 
1367 aa  133  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  33.11 
 
 
1309 aa  123  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.57 
 
 
883 aa  58.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.22 
 
 
725 aa  55.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 
502 aa  55.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  34.84 
 
 
502 aa  54.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 
502 aa  54.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  26.29 
 
 
643 aa  53.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.92 
 
 
626 aa  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.92 
 
 
614 aa  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1168  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.3 
 
 
275 aa  50.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
878 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1088  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.3 
 
 
275 aa  50.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.756407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.54 
 
 
614 aa  49.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.54 
 
 
614 aa  49.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
614 aa  49.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.54 
 
 
626 aa  49.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 
886 aa  48.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
968 aa  48.9  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
602 aa  48.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.89 
 
 
936 aa  48.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.12 
 
 
626 aa  48.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  28.09 
 
 
815 aa  48.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
615 aa  47.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.71 
 
 
639 aa  47.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
505 aa  47  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
620 aa  46.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 
635 aa  46.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.24 
 
 
620 aa  46.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 
635 aa  46.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  26.77 
 
 
762 aa  46.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.77 
 
 
762 aa  46.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 
614 aa  45.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 
611 aa  45.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  27.03 
 
 
591 aa  45.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>