67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1359 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  91 
 
 
1259 aa  2118    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  98.38 
 
 
1297 aa  2488    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  87.3 
 
 
1315 aa  2056    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  86.69 
 
 
1315 aa  2008    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  100 
 
 
1297 aa  2533    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  98.38 
 
 
1297 aa  2488    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  46.22 
 
 
1267 aa  981    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  84.33 
 
 
1313 aa  1889    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  69.32 
 
 
1471 aa  1394    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  69.48 
 
 
1548 aa  1363    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  44.72 
 
 
1265 aa  938    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  69.4 
 
 
1266 aa  1359    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  69.56 
 
 
1574 aa  1373    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  69.72 
 
 
1544 aa  1367    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  69.72 
 
 
1574 aa  1372    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  69.64 
 
 
1580 aa  1374    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  27.09 
 
 
1271 aa  365  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  32.01 
 
 
1157 aa  254  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  27.22 
 
 
1230 aa  247  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  32.59 
 
 
1157 aa  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  32.59 
 
 
1157 aa  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  32.59 
 
 
1157 aa  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  32.59 
 
 
1157 aa  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  32.41 
 
 
1140 aa  244  9e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  32.24 
 
 
1157 aa  243  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  32.41 
 
 
1157 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  25.83 
 
 
1309 aa  232  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  29.89 
 
 
1160 aa  228  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  30.2 
 
 
1159 aa  213  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  29.76 
 
 
1150 aa  212  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  29.76 
 
 
1180 aa  213  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  29.76 
 
 
1180 aa  211  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  30.51 
 
 
1172 aa  211  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  29.61 
 
 
1150 aa  210  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  36.42 
 
 
1164 aa  208  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  29.31 
 
 
1172 aa  197  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  29.17 
 
 
1172 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  32.42 
 
 
1542 aa  191  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  28.08 
 
 
1569 aa  191  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  41.11 
 
 
289 aa  190  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  28.55 
 
 
1588 aa  187  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  34.39 
 
 
1244 aa  183  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  28.96 
 
 
1186 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  34.39 
 
 
1331 aa  162  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  26.35 
 
 
1324 aa  148  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  28.27 
 
 
1367 aa  145  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.23 
 
 
725 aa  63.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
505 aa  59.7  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.46 
 
 
1676 aa  56.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1521  hypothetical protein  34 
 
 
172 aa  55.5  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  24.48 
 
 
1098 aa  51.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1088  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.49 
 
 
275 aa  50.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.756407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1168  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.49 
 
 
275 aa  50.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.42 
 
 
883 aa  49.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 
761 aa  49.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.79 
 
 
632 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 
827 aa  47.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
878 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
502 aa  47.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.76 
 
 
936 aa  46.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  30.07 
 
 
502 aa  46.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 
502 aa  46.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
808 aa  45.8  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
285 aa  45.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  31.07 
 
 
550 aa  45.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
189 aa  45.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
285 aa  45.1  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>