74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1381 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  87.22 
 
 		 1315 aa  2048    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  69.4 
 
 		 1574 aa  1362    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  100 
 
 		 1297 aa  2528    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  86.62 
 
 		 1315 aa  2006    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  69.56 
 
 		 1544 aa  1357    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  69.56 
 
 		 1574 aa  1361    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  69.48 
 
 		 1580 aa  1361    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  100 
 
 		 1297 aa  2528    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  46.22 
 
 		 1267 aa  986    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  69.24 
 
 		 1471 aa  1389    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  90.76 
 
 		 1259 aa  2105    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  69.32 
 
 		 1548 aa  1354    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  44.8 
 
 		 1265 aa  940    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  69.24 
 
 		 1266 aa  1347    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  84.25 
 
 		 1313 aa  1883    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  98.38 
 
 		 1297 aa  2488    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  27.4 
 
 		 1271 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  31.86 
 
 		 1157 aa  252  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  26.87 
 
 		 1230 aa  252  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  32.41 
 
 		 1157 aa  243  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1157 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  32.41 
 
 		 1157 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  32.41 
 
 		 1157 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  32.24 
 
 		 1140 aa  240  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  32.07 
 
 		 1157 aa  240  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  32.24 
 
 		 1157 aa  239  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  29.77 
 
 		 1160 aa  226  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  30.05 
 
 		 1159 aa  212  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  29.76 
 
 		 1180 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  29.76 
 
 		 1150 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  29.76 
 
 		 1180 aa  209  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  30.51 
 
 		 1172 aa  208  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  29.61 
 
 		 1150 aa  208  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  36.13 
 
 		 1164 aa  206  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  32.92 
 
 		 1542 aa  195  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  29.36 
 
 		 1172 aa  194  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  29.23 
 
 		 1172 aa  189  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  35.44 
 
 		 1244 aa  188  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  27.51 
 
 		 1569 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  40.74 
 
 		 289 aa  187  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  28.32 
 
 		 1588 aa  185  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  28.49 
 
 		 1186 aa  179  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  34.39 
 
 		 1331 aa  162  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  26.71 
 
 		 1324 aa  153  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  28.57 
 
 		 1367 aa  148  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  26.34 
 
 		 1309 aa  141  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.46 
 
 		 725 aa  68.6  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 505 aa  63.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1676 aa  60.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1521  hypothetical protein  34 
 
 		 172 aa  55.5  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  25.07 
 
 		 1098 aa  53.5  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 		 502 aa  52.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1088  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.48 
 
 		 275 aa  52.4  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.756407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1168  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.48 
 
 		 275 aa  52.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  31.37 
 
 		 502 aa  51.6  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 502 aa  51.6  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 878 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 808 aa  50.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 189 aa  47.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 444 aa  47.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.89 
 
 		 553 aa  47  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 827 aa  47  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 542 aa  47  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  26.89 
 
 		 603 aa  47.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.76 
 
 		 936 aa  47.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.49 
 
 		 1737 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.93 
 
 		 883 aa  46.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  30.77 
 
 		 1328 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 761 aa  46.2  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.57 
 
 		 632 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0632  tetratricopeptide TPR_2  32.29 
 
 		 541 aa  45.8  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 285 aa  45.8  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 795 aa  45.8  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.37 
 
 		 2401 aa  45.1  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>