73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1293 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  46.84 
 
 		 1267 aa  1002    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  68.81 
 
 		 1574 aa  1371    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  69.2 
 
 		 1544 aa  1363    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  68.88 
 
 		 1574 aa  1374    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  68.89 
 
 		 1580 aa  1371    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  87.12 
 
 		 1313 aa  1949    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  87.07 
 
 		 1297 aa  2080    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  97.64 
 
 		 1315 aa  2239    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  87.07 
 
 		 1297 aa  2080    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  87.15 
 
 		 1297 aa  2084    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  100 
 
 		 1315 aa  2546    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  68.8 
 
 		 1266 aa  1354    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  88.51 
 
 		 1259 aa  2047    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  68.88 
 
 		 1548 aa  1363    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  45.93 
 
 		 1265 aa  961    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  69.16 
 
 		 1471 aa  1402    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  27.7 
 
 		 1271 aa  376  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  25.95 
 
 		 1230 aa  257  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  33.33 
 
 		 1157 aa  252  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  31.31 
 
 		 1157 aa  231  8e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1157 aa  231  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  31.31 
 
 		 1157 aa  231  9e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  31.31 
 
 		 1157 aa  231  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  30.18 
 
 		 1160 aa  229  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  29.79 
 
 		 1159 aa  229  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  30.98 
 
 		 1140 aa  229  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  31.14 
 
 		 1157 aa  229  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  30.98 
 
 		 1157 aa  228  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  35.73 
 
 		 1164 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  30.73 
 
 		 1180 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  30.72 
 
 		 1150 aa  210  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  34.02 
 
 		 1150 aa  209  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  34.02 
 
 		 1172 aa  209  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  34.02 
 
 		 1180 aa  209  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  28.62 
 
 		 1569 aa  191  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  39.04 
 
 		 289 aa  190  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  34.06 
 
 		 1244 aa  189  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  28.45 
 
 		 1588 aa  186  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  30.75 
 
 		 1542 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  27.98 
 
 		 1172 aa  177  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  31.71 
 
 		 1172 aa  171  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  28.94 
 
 		 1186 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  32.99 
 
 		 1331 aa  150  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  28.85 
 
 		 1367 aa  146  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  26.24 
 
 		 1324 aa  142  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  26.58 
 
 		 1309 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.13 
 
 		 725 aa  69.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1676 aa  69.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1521  hypothetical protein  35 
 
 		 172 aa  58.2  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 878 aa  57.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  25.39 
 
 		 1098 aa  56.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.37 
 
 		 810 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 673 aa  50.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 909 aa  49.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  27.73 
 
 		 603 aa  49.3  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  28.27 
 
 		 625 aa  49.3  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 		 553 aa  49.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23.55 
 
 		 936 aa  48.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  40.91 
 
 		 566 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.05 
 
 		 632 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.84 
 
 		 729 aa  47  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1088  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.97 
 
 		 275 aa  46.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.756407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1168  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.97 
 
 		 275 aa  46.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.09 
 
 		 639 aa  46.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  22.43 
 
 		 594 aa  46.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 502 aa  45.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  28.76 
 
 		 502 aa  45.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 502 aa  45.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  39.77 
 
 		 566 aa  45.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 808 aa  45.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1660  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.92 
 
 		 370 aa  45.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.13 
 
 		 689 aa  45.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>