69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1260 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  68.38 
 
 		 1471 aa  1388    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  97.57 
 
 		 1315 aa  2281    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  86.84 
 
 		 1297 aa  2070    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  86.69 
 
 		 1297 aa  2065    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  100 
 
 		 1315 aa  2541    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  86.68 
 
 		 1313 aa  1935    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  86.69 
 
 		 1297 aa  2065    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  46.73 
 
 		 1267 aa  998    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  68.58 
 
 		 1574 aa  1360    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  68.96 
 
 		 1544 aa  1349    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  88.38 
 
 		 1259 aa  2042    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  67.9 
 
 		 1574 aa  1365    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  68.03 
 
 		 1548 aa  1353    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  45.59 
 
 		 1265 aa  962    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  68.65 
 
 		 1580 aa  1359    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  68.56 
 
 		 1266 aa  1342    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  27.85 
 
 		 1271 aa  375  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  26.76 
 
 		 1230 aa  274  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  33.33 
 
 		 1157 aa  254  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  31.65 
 
 		 1157 aa  233  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  31.65 
 
 		 1157 aa  233  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1157 aa  233  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  31.65 
 
 		 1157 aa  233  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  31.65 
 
 		 1140 aa  232  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  31.48 
 
 		 1157 aa  231  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  31.31 
 
 		 1157 aa  231  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  30.18 
 
 		 1160 aa  229  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  29.77 
 
 		 1159 aa  228  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  36 
 
 		 1164 aa  218  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  30.9 
 
 		 1180 aa  212  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  30.89 
 
 		 1150 aa  212  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  34.28 
 
 		 1150 aa  211  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  34.28 
 
 		 1180 aa  211  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  34.28 
 
 		 1172 aa  211  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  39.38 
 
 		 289 aa  192  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  28.52 
 
 		 1569 aa  191  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  33.82 
 
 		 1244 aa  187  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  31.46 
 
 		 1542 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  28.47 
 
 		 1588 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  28.73 
 
 		 1172 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  28.31 
 
 		 1172 aa  175  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  28.94 
 
 		 1186 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  31.02 
 
 		 1331 aa  152  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  28.53 
 
 		 1367 aa  147  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  30.2 
 
 		 1324 aa  144  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  26.85 
 
 		 1309 aa  124  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.69 
 
 		 725 aa  70.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1676 aa  67.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1521  hypothetical protein  35 
 
 		 172 aa  56.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 878 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 505 aa  53.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 673 aa  49.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 934 aa  49.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  42.05 
 
 		 566 aa  48.9  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  24.79 
 
 		 1098 aa  48.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 909 aa  47.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1660  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.92 
 
 		 370 aa  46.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.19 
 
 		 810 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1088  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.97 
 
 		 275 aa  47  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.756407  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.1 
 
 		 883 aa  46.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  40.91 
 
 		 566 aa  47  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1168  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.97 
 
 		 275 aa  47  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.89 
 
 		 882 aa  45.8  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  28.76 
 
 		 502 aa  45.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 502 aa  45.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 502 aa  45.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.05 
 
 		 632 aa  45.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1998  uncharacterized protein involved in fimbrial biogenesis  30.14 
 
 		 267 aa  45.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  23.37 
 
 		 545 aa  45.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>