16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32557 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_32557  predicted protein  100 
 
 		 614 aa  1279    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.33 
 
 		 576 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2749  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.69 
 
 		 610 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.37 
 
 		 610 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  23.06 
 
 		 559 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  23.62 
 
 		 613 aa  53.9  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 602 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 657 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40573  predicted protein  26.56 
 
 		 675 aa  47.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 790 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 605 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  40.26 
 
 		 572 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.2 
 
 		 699 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 759 aa  45.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 795 aa  43.9  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  30.68 
 
 		 546 aa  43.5  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>