261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1206 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1206  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  882    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1405  TPR repeat-containing protein  37.56 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00694073  normal  0.0323168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1552  TPR repeat-containing protein  45.67 
 
 
443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.35552 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0940  cytochrome c biogenesis factor  35.6 
 
 
427 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0687365  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1510  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 
395 aa  216  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0415  TPR domain-containing protein  34.98 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 
389 aa  208  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4773  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 
405 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  32.68 
 
 
407 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1375  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.33 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0247  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  29.75 
 
 
417 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00131868  normal  0.0142008 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0181  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 
417 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113058  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1952  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
424 aa  163  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 
279 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0233  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
415 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00046465  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0265  hypothetical protein  28.44 
 
 
415 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 
403 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  33.9 
 
 
466 aa  150  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0233  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0207631  unclonable  0.0000000000607109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3772  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.291283  normal  0.0233745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45280  cytochrome c-type biogenesis protein  29.81 
 
 
407 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.614364  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1878  cytochrome c biogenesis factor-like  26.85 
 
 
418 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000213055  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3725  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
415 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231024  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0228  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 
415 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.32958  hitchhiker  0.0059641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0233  tetratricopeptide domain protein  27.21 
 
 
417 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000133281  normal  0.136922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0230  tetratricopeptide domain-containing protein  27.21 
 
 
417 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000137712  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4022  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.21 
 
 
417 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000167013  hitchhiker  0.0000372591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3645  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.48 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0927546  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0230  tetratricopeptide domain-containing protein  26.98 
 
 
417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000773017  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1585  cytochrome c-type biogenesis protein  30.47 
 
 
400 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4285  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 
415 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188069 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1372  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
298 aa  140  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3248  tetratricopeptide TPR_2  26.93 
 
 
433 aa  139  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4657  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.39 
 
 
416 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0217  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3844  cytochrome c-type biogenesis protein  29.47 
 
 
406 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0192  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
416 aa  133  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000308025  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3567  tetratricopeptide region  27.14 
 
 
403 aa  134  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.359938  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30370  cytochrome c biogenesis protein  30.45 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1548  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
398 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608789  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3383  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
403 aa  129  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3888  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.28 
 
 
398 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0377  putative cytochrome c-type biogenesis protein  30.62 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0131086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2393  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00681412  hitchhiker  0.000021772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2855  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  33.22 
 
 
299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3385  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 
397 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469456  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2449  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  33.21 
 
 
299 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3016  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  24.5 
 
 
428 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169266  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3408  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  31.38 
 
 
393 aa  110  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.285071  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1690  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
295 aa  107  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0640145  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1038  putative cytochromre c biogenesis protein  25.44 
 
 
432 aa  106  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4054  cytochrome c biogenesis protein  37.5 
 
 
344 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1504  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.27 
 
 
408 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00909547  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0387  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.16 
 
 
408 aa  97.8  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1395  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.16 
 
 
408 aa  97.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1834  tetratricopeptide TPR_2  27.05 
 
 
367 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2273  putative cytochrome c-type biogenesis protein precursor  25.89 
 
 
404 aa  94.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.21015  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0633  cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  28.66 
 
 
389 aa  93.6  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545808  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1351  putative cytochrome c-type biogenesis protein  24.18 
 
 
426 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.0884776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1740  putative cytochrome c-type biogenesis protein  25.16 
 
 
426 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000153485  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03066  putative cytochrome c-type biogenesis protein  22.9 
 
 
428 aa  90.9  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3450  tetratricopeptide TPR_4  27.92 
 
 
367 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0582  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
222 aa  90.1  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.149034  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1558  cytochrome c-type biogenesis protein  24.55 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144138  normal  0.094009 
 
 
-
 
NC_004310  BR0607  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  27.85 
 
 
379 aa  86.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06070  C-type cytochrome biogenesis protein  27.66 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000967954  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2001  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  25.56 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00857  C-type cytochrome biogenesis protein  27.66 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0160973  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1637  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  25.17 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00151362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002849  cytochrome c heme lyase subunit CcmH  22.57 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2720  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  26.59 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0606  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.09 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03127  hypothetical protein  22.67 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1655  tetratricopeptide TPR_4  27.35 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2130  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  26.69 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74489  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4054  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331246  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3778  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0805  cytochrome c biogenesis factor-like protein  23.21 
 
 
471 aa  79.7  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2416  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.56 
 
 
289 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1437  cytochrome c-type biogenesis protein CycH / CcmH  27.65 
 
 
367 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3071  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  24.91 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0938  tetratricopeptide domain-containing protein  24.51 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70703  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0401  TPR repeat-containing cytochrome c-type biogenesis protein  22.63 
 
 
294 aa  76.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4991  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  23.94 
 
 
495 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000230784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0436  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  24.9 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1362  cycH protein  27.09 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1408  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.7 
 
 
552 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1683  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  26.51 
 
 
523 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4144  cytochrome c-type biogenesis protein H2  31.93 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1069  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.69 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2182  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  23.7 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.999893  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2382  cytochrome c-type biogenesis protein H1  31.93 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2473  cytochrome c-type biogenesis protein H2  31.09 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.677618  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2487  cytochrome c-type biogenesis protein H2  32.46 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  hitchhiker  0.00973673 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4023  cytochrome c-type biogenesis protein H2  31.09 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2431  cytochrome c-type biogenesis protein H2  31.62 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.684186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4095  cytochrome c-type biogenesis protein H2  31.62 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1414  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47005  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4202  cytochrome c-type biogenesis protein H2  31.62 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1403  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  26.1 
 
 
516 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0489784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>