91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0606 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0607  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  99.47 
 
 
379 aa  720    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0606  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  100 
 
 
390 aa  774    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2671  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  77.04 
 
 
379 aa  542  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1834  tetratricopeptide TPR_2  40.53 
 
 
367 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0633  cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  40.82 
 
 
389 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545808  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1362  cycH protein  42.63 
 
 
382 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2130  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  40.96 
 
 
368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74489  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3450  tetratricopeptide TPR_4  40.21 
 
 
367 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3071  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  39.3 
 
 
366 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2001  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  40.97 
 
 
385 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0897  tetratricopeptide TPR_2  42.59 
 
 
412 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.380164  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1191  cytochrome c-type biogenesis protein cycH / CcmH  40.73 
 
 
367 aa  210  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1069  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  38.3 
 
 
402 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0920  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  37.63 
 
 
392 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922006  normal  0.0740975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4168  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  42.09 
 
 
372 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1437  cytochrome c-type biogenesis protein CycH / CcmH  38.96 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1655  tetratricopeptide TPR_4  42.51 
 
 
407 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4433  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  37.62 
 
 
420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0436  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  36.27 
 
 
372 aa  182  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1403  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  37.78 
 
 
516 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0489784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4991  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  34.45 
 
 
495 aa  176  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000230784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1683  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  34.73 
 
 
523 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1408  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  34.15 
 
 
552 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0938  tetratricopeptide domain-containing protein  37.06 
 
 
360 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70703  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3408  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  31.23 
 
 
393 aa  145  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.285071  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3778  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 
383 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4054  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 
383 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331246  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0968  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  32.64 
 
 
412 aa  143  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2230  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  33.97 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.863984  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2685  putative cytochrome c-type biogenesis protein, cycH  31.09 
 
 
417 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2182  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  30.53 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.999893  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0511  putative cytochrome c-type biogenesis protein, CycH  32.35 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1343  putative cytochrome c-type biogenesis protein, CycH  30.35 
 
 
415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal  0.0463819 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1878  cytochrome c biogenesis factor-like protein  31.02 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0591  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
324 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71044  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
337 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0430  putative cytochrome c-type biogenesis protein CycH  25.91 
 
 
278 aa  99.4  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  28.3 
 
 
466 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1656  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 
283 aa  94  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.243033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3893  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.62 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0160389  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1206  hypothetical protein  28.09 
 
 
436 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2772  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0940  cytochrome c biogenesis factor  26.17 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0687365  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45280  cytochrome c-type biogenesis protein  31.6 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.614364  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1690  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0640145  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0032  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
494 aa  66.6  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.949797  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3645  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.4 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0927546  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2929  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.52 
 
 
239 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.591538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
403 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1952  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
424 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698376  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2855  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30 
 
 
299 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1585  cytochrome c-type biogenesis protein  28.72 
 
 
400 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.69 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3888  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.07 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1393  tetratricopeptide TPR_4  27.13 
 
 
232 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2449  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  34.25 
 
 
299 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2393  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
293 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00681412  hitchhiker  0.000021772 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1510  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1548  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
398 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608789  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30370  cytochrome c biogenesis protein  31.88 
 
 
405 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3844  cytochrome c-type biogenesis protein  30.26 
 
 
406 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3993  cytochrome c biogenesis factor-like protein  30.06 
 
 
210 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3567  tetratricopeptide region  24.26 
 
 
403 aa  53.9  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.359938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1878  cytochrome c biogenesis factor-like  23.38 
 
 
418 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000213055  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1414  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47005  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1513  cytochrome c biogenesis factor  28.05 
 
 
224 aa  50.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.774249 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1405  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
399 aa  49.7  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00694073  normal  0.0323168 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0401  TPR repeat-containing cytochrome c-type biogenesis protein  19.86 
 
 
294 aa  49.3  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1375  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  21.52 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1558  cytochrome c-type biogenesis protein  25.79 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144138  normal  0.094009 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3331  cytochrome c-type biogenesis family protein  43.86 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3285  cytochrome c biogenesis factor  27.35 
 
 
216 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3385  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469456  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1465  cytochrome C biogenesis protein  43.86 
 
 
350 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141768  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02080  hypothetical protein  43.86 
 
 
350 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0747  cytochrome c-type biogenesis family protein  43.86 
 
 
350 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238814  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2342  cytochrome c-type biogenesis family protein  43.86 
 
 
350 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1456  cytochrome C biogenesis protein  43.86 
 
 
350 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2493  cytochrome c-type biogenesis family protein  43.86 
 
 
350 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2332  cytochrome c-type biogenesis family protein  43.86 
 
 
350 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1620  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 
310 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3248  tetratricopeptide TPR_2  24.05 
 
 
433 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02121  heme lyase, CcmH subunit  43.86 
 
 
350 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3016  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  20.9 
 
 
428 aa  47  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169266  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1740  putative cytochrome c-type biogenesis protein  25.88 
 
 
426 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000153485  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  29.31 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2273  putative cytochrome c-type biogenesis protein precursor  21.68 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.21015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1038  putative cytochromre c biogenesis protein  24.09 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002849  cytochrome c heme lyase subunit CcmH  23.85 
 
 
404 aa  43.5  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>