37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0430 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0430  putative cytochrome c-type biogenesis protein CycH  100 
 
 
278 aa  569  1e-161  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2671  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  35.91 
 
 
379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0607  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  26.28 
 
 
379 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0606  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.91 
 
 
390 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0633  cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  33.33 
 
 
389 aa  79  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545808  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4168  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  33.61 
 
 
372 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1069  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.37 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0436  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.75 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4433  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  34.45 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4991  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.48 
 
 
495 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000230784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0920  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  34.45 
 
 
392 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922006  normal  0.0740975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1362  cycH protein  34.03 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1655  tetratricopeptide TPR_4  26.44 
 
 
407 aa  62.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0897  tetratricopeptide TPR_2  25.49 
 
 
412 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.380164  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0938  tetratricopeptide domain-containing protein  23.01 
 
 
360 aa  58.9  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70703  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1191  cytochrome c-type biogenesis protein cycH / CcmH  27.17 
 
 
367 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3450  tetratricopeptide TPR_4  27.94 
 
 
367 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2001  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  27.82 
 
 
385 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2130  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  22.78 
 
 
368 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74489  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2230  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  32.37 
 
 
384 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.863984  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1408  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.71 
 
 
552 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1403  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.71 
 
 
516 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0489784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1683  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.11 
 
 
523 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1834  tetratricopeptide TPR_2  24.19 
 
 
367 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3993  cytochrome c biogenesis factor-like protein  31.78 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1542  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
358 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000957604  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1393  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 
232 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1656  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.243033 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 
366 aa  46.2  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
1406 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3255  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00360912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1437  cytochrome c-type biogenesis protein CycH / CcmH  23.91 
 
 
367 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02530  bud site selection-related protein, putative  29.89 
 
 
697 aa  42.7  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.15 
 
 
274 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.23 
 
 
340 aa  42  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 
808 aa  42  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>