165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1656 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1656  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
283 aa  555  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.243033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3450  tetratricopeptide TPR_4  31.69 
 
 
367 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1834  tetratricopeptide TPR_2  31.75 
 
 
367 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2130  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  32.36 
 
 
368 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74489  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2001  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  32.74 
 
 
385 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0938  tetratricopeptide domain-containing protein  34.54 
 
 
360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70703  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4054  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
383 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331246  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3778  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
383 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0436  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  29.79 
 
 
372 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1191  cytochrome c-type biogenesis protein cycH / CcmH  34.52 
 
 
367 aa  95.5  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0607  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  28.62 
 
 
379 aa  92.8  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3071  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  31.88 
 
 
366 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4991  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  26.86 
 
 
495 aa  92  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000230784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0633  cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  28.12 
 
 
389 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545808  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1437  cytochrome c-type biogenesis protein CycH / CcmH  34.16 
 
 
367 aa  90.1  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1362  cycH protein  30.1 
 
 
382 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0606  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.99 
 
 
390 aa  90.1  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1403  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  29.73 
 
 
516 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0489784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1408  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.27 
 
 
552 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4168  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  29.72 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0591  TPR repeat-containing protein  39.55 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71044  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1683  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  29.41 
 
 
523 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2671  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  29.48 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0897  tetratricopeptide TPR_2  32.82 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.380164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4433  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.87 
 
 
420 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2230  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  26.95 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.863984  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1069  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.41 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3408  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  27.24 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.285071  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0920  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.67 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922006  normal  0.0740975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1655  tetratricopeptide TPR_4  29.24 
 
 
407 aa  69.3  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1878  cytochrome c biogenesis factor-like  24.38 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000213055  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3993  cytochrome c biogenesis factor-like protein  36.57 
 
 
210 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4626  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  29.25 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.70936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1393  tetratricopeptide TPR_4  31.4 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4541  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  28.86 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.942267  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1206  hypothetical protein  23.21 
 
 
436 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4676  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  28.57 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248769  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4627  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  28.57 
 
 
206 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00857  C-type cytochrome biogenesis protein  30.88 
 
 
337 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0160973  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06070  C-type cytochrome biogenesis protein  30.88 
 
 
337 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000967954  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2182  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  26.69 
 
 
406 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.999893  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4535  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  27.89 
 
 
206 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1952  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 
424 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698376  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2652  cytochrome c biogenesis factor  33.04 
 
 
216 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1510  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
395 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3567  tetratricopeptide region  24.15 
 
 
403 aa  60.1  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.359938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0217  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 
417 aa  60.1  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270987  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1372  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0181  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
417 aa  59.7  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0265  hypothetical protein  25.16 
 
 
415 aa  59.7  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3285  cytochrome c biogenesis factor  30.51 
 
 
216 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982918  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0233  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 
415 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0207631  unclonable  0.0000000000607109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0233  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
415 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00046465  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0228  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
415 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.32958  hitchhiker  0.0059641 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1375  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  23.95 
 
 
399 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2772  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4657  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  24 
 
 
416 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855985 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0032  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 
494 aa  55.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.949797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3893  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  33.06 
 
 
374 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0160389  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3248  tetratricopeptide TPR_2  26.62 
 
 
433 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0192  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
416 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000308025  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03948  heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfG  25.22 
 
 
198 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3916  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 
198 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03908  hypothetical protein  25.22 
 
 
198 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  25.37 
 
 
466 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0377  putative cytochrome c-type biogenesis protein  25.35 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0131086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4632  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  25.22 
 
 
198 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1513  cytochrome c biogenesis factor  33.13 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.774249 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3951  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  25.22 
 
 
198 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2729  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  28 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4597  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  25.22 
 
 
198 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4321  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  25.22 
 
 
198 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4538  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  25.22 
 
 
198 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5581  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  25.22 
 
 
198 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3725  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 
415 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231024  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2685  putative cytochrome c-type biogenesis protein, cycH  26.17 
 
 
417 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
402 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4773  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
405 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0482  formate-dependent nitrite reductase, nrfG protein  27.62 
 
 
224 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1552  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 
443 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.35552 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4285  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
415 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1414  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
296 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47005  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1548  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 
398 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608789  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1038  putative cytochromre c biogenesis protein  22.78 
 
 
432 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2426  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  28.07 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45280  cytochrome c-type biogenesis protein  26.59 
 
 
407 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.614364  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 
403 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 
4079 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0401  TPR repeat-containing cytochrome c-type biogenesis protein  21.2 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0247  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  25.69 
 
 
417 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00131868  normal  0.0142008 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1343  putative cytochrome c-type biogenesis protein, CycH  25.5 
 
 
415 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal  0.0463819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3888  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.33 
 
 
398 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  31.21 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2929  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.54 
 
 
239 aa  50.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.591538 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0968  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  24.66 
 
 
412 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1625  truncated C-type cytochrome biogenesis protein  28.65 
 
 
219 aa  49.3  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 
3560 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4022  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.32 
 
 
417 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000167013  hitchhiker  0.0000372591 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>