26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2652 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2652  cytochrome c biogenesis factor  100 
 
 		 216 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3285  cytochrome c biogenesis factor  76.85 
 
 		 216 aa  347  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982918  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1656  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.243033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1834  tetratricopeptide TPR_2  27.33 
 
 		 367 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3450  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2001  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  27.83 
 
 		 385 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4433  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.57 
 
 		 420 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2130  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  34.62 
 
 		 368 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74489  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 337 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 566 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0938  tetratricopeptide domain-containing protein  28.49 
 
 		 360 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4168  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  26.67 
 
 		 372 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0591  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1343  putative cytochrome c-type biogenesis protein, CycH  35.21 
 
 		 415 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal  0.0463819 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2685  putative cytochrome c-type biogenesis protein, cycH  35.21 
 
 		 417 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1878  cytochrome c biogenesis factor-like protein  38.71 
 
 		 431 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 715 aa  45.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2671  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  24.35 
 
 		 379 aa  45.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3893  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.26 
 
 		 374 aa  45.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0160389  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1513  cytochrome c biogenesis factor  31.19 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.774249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0897  tetratricopeptide TPR_2  25.58 
 
 		 412 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.380164  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 486 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 605 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  28.72 
 
 		 643 aa  42  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3408  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  22.05 
 
 		 393 aa  41.6  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.285071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>