87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1625 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1625  truncated C-type cytochrome biogenesis protein  100 
 
 		 219 aa  431  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1568  TPR repeat-containing protein  97.72 
 
 		 219 aa  348  3e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06070  C-type cytochrome biogenesis protein  50.49 
 
 		 337 aa  167  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000967954  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00857  C-type cytochrome biogenesis protein  50.49 
 
 		 337 aa  167  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0160973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 279 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  28.35 
 
 		 466 aa  82  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2707  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.33 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1405  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00694073  normal  0.0323168 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1206  hypothetical protein  27.51 
 
 		 436 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  29.19 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1372  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0938  tetratricopeptide domain-containing protein  32.62 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1510  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 395 aa  62  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1375  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.97 
 
 		 399 aa  62  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2393  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00681412  hitchhiker  0.000021772 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1656  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.243033 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1690  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0640145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.42 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2001  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  29.01 
 
 		 385 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1620  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 310 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0415  TPR domain-containing protein  30.58 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1403  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.05 
 
 		 516 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0489784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1408  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.05 
 
 		 552 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1191  cytochrome c-type biogenesis protein cycH / CcmH  30.67 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3450  tetratricopeptide TPR_4  27.78 
 
 		 367 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1683  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.44 
 
 		 523 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3248  tetratricopeptide TPR_2  28.22 
 
 		 433 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 337 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2130  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.3 
 
 		 368 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74489  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0897  tetratricopeptide TPR_2  29.8 
 
 		 412 aa  51.6  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.380164  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2230  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.69 
 
 		 384 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.863984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0940  cytochrome c biogenesis factor  30.93 
 
 		 427 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0687365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1834  tetratricopeptide TPR_2  25.95 
 
 		 367 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00221  tetratricopeptide repeat domain protein  28.83 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1552  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 443 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.35552 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0032  TPR repeat-containing protein  38.84 
 
 		 494 aa  48.9  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.949797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45280  cytochrome c-type biogenesis protein  25 
 
 		 407 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.614364  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0895  hypothetical protein  25.23 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1437  cytochrome c-type biogenesis protein CycH / CcmH  27.33 
 
 		 367 aa  48.5  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1362  cycH protein  31.25 
 
 		 382 aa  48.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 389 aa  48.1  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4991  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.34 
 
 		 495 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1393  tetratricopeptide TPR_4  25.87 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0247  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  24.73 
 
 		 417 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00131868  normal  0.0142008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0591  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 324 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30370  cytochrome c biogenesis protein  26.61 
 
 		 405 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.59 
 
 		 1979 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0926  hypothetical protein  25.68 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1655  tetratricopeptide TPR_4  26.47 
 
 		 407 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  25.64 
 
 		 661 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3725  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 415 aa  45.1  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231024  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 878 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 405 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 700 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 748 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 265 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.78 
 
 		 1764 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 563 aa  43.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 399 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0436  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  26.74 
 
 		 372 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.23 
 
 		 265 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 573 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3772  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 405 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.291283  normal  0.0233745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25.66 
 
 		 436 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 2262 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4054  cytochrome c biogenesis protein  26.13 
 
 		 344 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 		 1737 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.48 
 
 		 572 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  29.63 
 
 		 290 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1375  hypothetical protein  30.23 
 
 		 282 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.668942  normal  0.512561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3645  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  24.03 
 
 		 396 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0927546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0905  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.06 
 
 		 253 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 217 aa  42  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2045  tetratricopeptide TPR_2  27.91 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000222916  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0233  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 415 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0207631  unclonable  0.0000000000607109 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  22.22 
 
 		 622 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.96 
 
 		 810 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0633  cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  27.1 
 
 		 389 aa  41.6  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>