98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4433 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4433  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  100 
 
 		 420 aa  789    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4168  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  73.81 
 
 		 372 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1403  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  55.53 
 
 		 516 aa  342  9e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0489784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1408  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  54.06 
 
 		 552 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1683  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  54.52 
 
 		 523 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4991  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  49.49 
 
 		 495 aa  293  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0633  cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  40.57 
 
 		 389 aa  235  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1834  tetratricopeptide TPR_2  39.48 
 
 		 367 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2130  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  38.25 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74489  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3450  tetratricopeptide TPR_4  38.87 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3071  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  40.1 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2001  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  37.85 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0436  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  39.81 
 
 		 372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1069  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  39.28 
 
 		 402 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0607  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  39.42 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0606  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  39.66 
 
 		 390 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0920  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  39.28 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922006  normal  0.0740975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2671  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  37.8 
 
 		 379 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1655  tetratricopeptide TPR_4  40.16 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1437  cytochrome c-type biogenesis protein CycH / CcmH  37.93 
 
 		 367 aa  196  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1362  cycH protein  36.19 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1191  cytochrome c-type biogenesis protein cycH / CcmH  37.35 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2230  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  37.74 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.863984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0938  tetratricopeptide domain-containing protein  34.47 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0897  tetratricopeptide TPR_2  35.56 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.380164  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0511  putative cytochrome c-type biogenesis protein, CycH  33.49 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3408  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  31.42 
 
 		 393 aa  133  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2182  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  30.86 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.999893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2685  putative cytochrome c-type biogenesis protein, cycH  32.43 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1343  putative cytochrome c-type biogenesis protein, CycH  32.18 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal  0.0463819 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1878  cytochrome c biogenesis factor-like protein  33.24 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0968  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  28.71 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3893  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  33.24 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0160389  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3778  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 383 aa  99.8  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4054  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 383 aa  99.8  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331246  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0591  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0032  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 494 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.949797  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1656  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 283 aa  89  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.243033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  25.33 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2393  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00681412  hitchhiker  0.000021772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1206  hypothetical protein  25 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2772  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 316 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2855  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.53 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0430  putative cytochrome c-type biogenesis protein CycH  34.45 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45280  cytochrome c-type biogenesis protein  26.34 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.614364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4773  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1878  cytochrome c biogenesis factor-like  24.85 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000213055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1510  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3248  tetratricopeptide TPR_2  31.01 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1375  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.9 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1552  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.35552 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0377  putative cytochrome c-type biogenesis protein  32.35 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0131086 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1690  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0640145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2449  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.45 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1585  cytochrome c-type biogenesis protein  22.69 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.21 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0415  TPR domain-containing protein  27.72 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3016  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  24.03 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0940  cytochrome c biogenesis factor  25.55 
 
 		 427 aa  53.5  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0687365  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3888  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  26.85 
 
 		 398 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3285  cytochrome c biogenesis factor  28.97 
 
 		 216 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982918  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1038  putative cytochromre c biogenesis protein  21.05 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1513  cytochrome c biogenesis factor  31.61 
 
 		 224 aa  50.8  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.774249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1393  tetratricopeptide TPR_4  27.57 
 
 		 232 aa  50.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3645  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.46 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0927546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2652  cytochrome c biogenesis factor  28.57 
 
 		 216 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0181  TPR repeat-containing protein  21.04 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0247  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  22.13 
 
 		 417 aa  50.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00131868  normal  0.0142008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1952  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 424 aa  49.7  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698376  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 207 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3567  tetratricopeptide region  21.07 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.359938  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1548  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608789  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  31.14 
 
 		 2679 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4541  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  27.59 
 
 		 206 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.942267  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 2651 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4627  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  27.59 
 
 		 206 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4676  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  27.59 
 
 		 206 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3385  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4626  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  26.72 
 
 		 206 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.70936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4535  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  26.72 
 
 		 206 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 808 aa  46.6  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1372  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 298 aa  46.6  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30370  cytochrome c biogenesis protein  27.78 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.92 
 
 		 2240 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4054  cytochrome c biogenesis protein  29.32 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1405  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00694073  normal  0.0323168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3772  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.291283  normal  0.0233745 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.22 
 
 		 1764 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0265  hypothetical protein  22.53 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2273  putative cytochrome c-type biogenesis protein precursor  24.41 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.21015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2929  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.9 
 
 		 239 aa  43.9  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.591538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3725  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231024  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0192  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000308025  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 732 aa  43.1  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>