157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0377 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0377  putative cytochrome c-type biogenesis protein  100 
 
 		 312 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0131086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1206  hypothetical protein  29.67 
 
 		 436 aa  136  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1552  TPR repeat-containing protein  44.97 
 
 		 443 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.35552 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2449  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  39.13 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4773  TPR repeat-containing protein  38.93 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  46.1 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  32.6 
 
 		 466 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1405  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 		 399 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00694073  normal  0.0323168 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4054  cytochrome c biogenesis protein  43.52 
 
 		 344 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1510  TPR repeat-containing protein  35.22 
 
 		 395 aa  112  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2393  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00681412  hitchhiker  0.000021772 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1375  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  34.52 
 
 		 399 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2855  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  36.73 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  33.22 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0415  TPR domain-containing protein  31.1 
 
 		 405 aa  98.6  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3567  tetratricopeptide region  26.8 
 
 		 403 aa  94.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.359938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3772  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 405 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.291283  normal  0.0233745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1952  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 424 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0940  cytochrome c biogenesis factor  30.62 
 
 		 427 aa  90.1  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0687365  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3248  tetratricopeptide TPR_2  28.72 
 
 		 433 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1585  cytochrome c-type biogenesis protein  33.33 
 
 		 400 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1372  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  33.33 
 
 		 407 aa  86.3  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45280  cytochrome c-type biogenesis protein  31.05 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.614364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1690  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0640145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1834  tetratricopeptide TPR_2  30.23 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1403  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.92 
 
 		 516 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0489784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3385  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1683  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.92 
 
 		 523 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3645  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  33.7 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0927546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2001  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  29.02 
 
 		 385 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0938  tetratricopeptide domain-containing protein  30.26 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1408  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.52 
 
 		 552 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1548  TPR repeat-containing protein  31.77 
 
 		 398 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608789  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0181  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113058  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30370  cytochrome c biogenesis protein  30.71 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3450  tetratricopeptide TPR_4  31.25 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3888  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.41 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4991  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  29.1 
 
 		 495 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0247  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  23.3 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00131868  normal  0.0142008 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03127  hypothetical protein  23.78 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002849  cytochrome c heme lyase subunit CcmH  23.55 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0217  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270987  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4168  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  29.39 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0633  cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  28.97 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0582  TPR repeat-containing protein  40.15 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.149034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0436  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.34 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1414  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4657  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  24.6 
 
 		 416 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855985 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2273  putative cytochrome c-type biogenesis protein precursor  25.64 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.21015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3844  cytochrome c-type biogenesis protein  31.27 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1362  cycH protein  30 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1437  cytochrome c-type biogenesis protein CycH / CcmH  29.07 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4433  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.06 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1191  cytochrome c-type biogenesis protein cycH / CcmH  29.48 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3725  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3383  TPR repeat-containing protein  22.95 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0265  hypothetical protein  24.31 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1620  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1655  tetratricopeptide TPR_4  29.3 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0233  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0207631  unclonable  0.0000000000607109 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0926  hypothetical protein  30.6 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0895  hypothetical protein  30.6 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4285  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3071  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  29.62 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0233  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00046465  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1069  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.08 
 
 		 402 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0192  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000308025  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1504  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  23.13 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00909547  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0387  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  21.61 
 
 		 408 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1656  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.243033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0228  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.32958  hitchhiker  0.0059641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4022  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  23.31 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000167013  hitchhiker  0.0000372591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0230  tetratricopeptide domain-containing protein  23.31 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000137712  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1395  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  21.61 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2130  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.29 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74489  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1878  cytochrome c biogenesis factor-like  22.79 
 
 		 418 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000213055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0233  tetratricopeptide domain protein  23.23 
 
 		 417 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000133281  normal  0.136922 
 
 
-
 
NC_004310  BR0607  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  24.22 
 
 		 379 aa  53.5  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2230  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.19 
 
 		 384 aa  52.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.863984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0032  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 494 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.949797  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0897  tetratricopeptide TPR_2  29.37 
 
 		 412 aa  52.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.380164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1038  putative cytochromre c biogenesis protein  21.46 
 
 		 432 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0920  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.4 
 
 		 392 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922006  normal  0.0740975 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1740  putative cytochrome c-type biogenesis protein  24.9 
 
 		 426 aa  52  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000153485  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3016  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  21.22 
 
 		 428 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0230  tetratricopeptide domain-containing protein  22.9 
 
 		 417 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000773017  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3407  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0401  TPR repeat-containing cytochrome c-type biogenesis protein  21.38 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0606  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.46 
 
 		 390 aa  50.4  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0747  cytochrome c-type biogenesis family protein  27.2 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3331  cytochrome c-type biogenesis family protein  27.2 
 
 		 350 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1465  cytochrome C biogenesis protein  27.2 
 
 		 350 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141768  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1637  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  24.06 
 
 		 404 aa  49.3  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00151362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2342  cytochrome c-type biogenesis family protein  27.2 
 
 		 350 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0805  cytochrome c biogenesis factor-like protein  21.79 
 
 		 471 aa  49.3  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1558  cytochrome c-type biogenesis protein  24.2 
 
 		 426 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144138  normal  0.094009 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4535  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  31.25 
 
 		 206 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1456  cytochrome C biogenesis protein  27.2 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>