102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1655 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1655  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 407 aa  777    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3071  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  49.74 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2001  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  47.38 
 
 		 385 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3450  tetratricopeptide TPR_4  47.64 
 
 		 367 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2130  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  47.11 
 
 		 368 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74489  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1834  tetratricopeptide TPR_2  45.38 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1437  cytochrome c-type biogenesis protein CycH / CcmH  46.44 
 
 		 367 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0633  cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  43.59 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1191  cytochrome c-type biogenesis protein cycH / CcmH  44.85 
 
 		 367 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1362  cycH protein  41.05 
 
 		 382 aa  245  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0607  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  43.29 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2671  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  41.64 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0436  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  44.08 
 
 		 372 aa  237  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0606  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  43.17 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4168  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  45.56 
 
 		 372 aa  229  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0920  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  40.26 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922006  normal  0.0740975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1069  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  39.47 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2230  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  40.99 
 
 		 384 aa  213  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.863984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4433  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  39.28 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0938  tetratricopeptide domain-containing protein  41.13 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1403  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  40.5 
 
 		 516 aa  193  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0489784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1683  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  38.67 
 
 		 523 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1408  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  37.77 
 
 		 552 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3778  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4054  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331246  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4991  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  37.59 
 
 		 495 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3408  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  33.15 
 
 		 393 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0897  tetratricopeptide TPR_2  37.33 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.380164  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0511  putative cytochrome c-type biogenesis protein, CycH  32.22 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  35.18 
 
 		 337 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2182  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  30.47 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.999893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2685  putative cytochrome c-type biogenesis protein, cycH  32.38 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0968  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  29.83 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1878  cytochrome c biogenesis factor-like protein  33.97 
 
 		 431 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0591  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 324 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1343  putative cytochrome c-type biogenesis protein, CycH  32.06 
 
 		 415 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal  0.0463819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3893  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.65 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0160389  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  28.53 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0032  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 494 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.949797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1206  hypothetical protein  28.15 
 
 		 436 aa  94  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2772  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1393  tetratricopeptide TPR_4  37.58 
 
 		 232 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1656  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.243033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1878  cytochrome c biogenesis factor-like  24.22 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000213055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3645  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.13 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0927546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1510  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1585  cytochrome c-type biogenesis protein  27.97 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2393  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00681412  hitchhiker  0.000021772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1552  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.35552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45280  cytochrome c-type biogenesis protein  27.63 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.614364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3385  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1375  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  24.9 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3888  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.93 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0377  putative cytochrome c-type biogenesis protein  31.63 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0131086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1548  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608789  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0430  putative cytochrome c-type biogenesis protein CycH  26.44 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2855  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  29.37 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2929  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  33.33 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.591538 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2857  cytochrome c biogenesis factor-like protein  34.5 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1405  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00694073  normal  0.0323168 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3248  tetratricopeptide TPR_2  27.87 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1038  putative cytochromre c biogenesis protein  21.46 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3844  cytochrome c-type biogenesis protein  28.4 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1513  cytochrome c biogenesis factor  30.72 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.774249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3993  cytochrome c biogenesis factor-like protein  43.48 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1414  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47005  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1372  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30370  cytochrome c biogenesis protein  27.6 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1690  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 295 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0640145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1351  putative cytochrome c-type biogenesis protein  21.93 
 
 		 426 aa  53.9  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.0884776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1740  putative cytochrome c-type biogenesis protein  22.3 
 
 		 426 aa  53.1  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000153485  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4054  cytochrome c biogenesis protein  31.6 
 
 		 344 aa  53.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3567  tetratricopeptide region  21.03 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.359938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.96 
 
 		 810 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  25.83 
 
 		 340 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 207 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2449  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.62 
 
 		 299 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1952  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 424 aa  49.7  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698376  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.39 
 
 		 407 aa  49.7  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 808 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4773  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 792 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0265  hypothetical protein  21.05 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1558  cytochrome c-type biogenesis protein  21.96 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144138  normal  0.094009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0181  TPR repeat-containing protein  19.85 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113058  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 878 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0415  TPR domain-containing protein  22.9 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  28.36 
 
 		 884 aa  46.6  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.22 
 
 		 738 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 289 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 2651 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0401  TPR repeat-containing cytochrome c-type biogenesis protein  19.26 
 
 		 294 aa  44.3  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 1069 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.5 
 
 		 887 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>