93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3893 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3893  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  100 
 
 		 374 aa  712    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0160389  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2130  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  32.7 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74489  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0938  tetratricopeptide domain-containing protein  35.55 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3450  tetratricopeptide TPR_4  33.53 
 
 		 367 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2001  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  31.99 
 
 		 385 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1834  tetratricopeptide TPR_2  34.6 
 
 		 367 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0633  cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  34.72 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3071  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  32.7 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1362  cycH protein  32.47 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1655  tetratricopeptide TPR_4  31.71 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0897  tetratricopeptide TPR_2  32.39 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.380164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2182  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  29.65 
 
 		 406 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.999893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4433  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  33.46 
 
 		 420 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3408  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  29.05 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1437  cytochrome c-type biogenesis protein CycH / CcmH  31.67 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4991  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.21 
 
 		 495 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4168  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.62 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2671  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  30.7 
 
 		 379 aa  96.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0607  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  29.32 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0606  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  29.43 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  26.89 
 
 		 466 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0436  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.27 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1069  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.53 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0032  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 494 aa  87  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.949797  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1191  cytochrome c-type biogenesis protein cycH / CcmH  31.4 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0968  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  25.51 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0591  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3778  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0920  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922006  normal  0.0740975 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4054  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331246  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2685  putative cytochrome c-type biogenesis protein, cycH  27.65 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2772  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1343  putative cytochrome c-type biogenesis protein, CycH  26.67 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal  0.0463819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1403  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.51 
 
 		 516 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0489784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1408  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  32.01 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1683  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.13 
 
 		 523 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0511  putative cytochrome c-type biogenesis protein, CycH  25.4 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1656  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 283 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.243033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3888  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.82 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3385  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1585  cytochrome c-type biogenesis protein  27.38 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1878  cytochrome c biogenesis factor-like protein  25.19 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3645  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.82 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0927546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1548  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608789  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1878  cytochrome c biogenesis factor-like  23.16 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000213055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2230  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.863984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3383  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2393  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00681412  hitchhiker  0.000021772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18031  hypothetical protein  24.56 
 
 		 262 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 201 aa  49.7  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1513  cytochrome c biogenesis factor  35.64 
 
 		 224 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.774249 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  44.83 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1375  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  21.56 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 942 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2117  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.31 
 
 		 207 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45280  cytochrome c-type biogenesis protein  26.09 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.614364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1510  TPR repeat-containing protein  22.4 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 199 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3285  cytochrome c biogenesis factor  32.89 
 
 		 216 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 628 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0741  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 191 aa  47.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.59 
 
 		 340 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 235 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 389 aa  46.6  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2890  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 599 aa  46.6  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.85 
 
 		 807 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1740  putative cytochrome c-type biogenesis protein  23.75 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000153485  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.66 
 
 		 689 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1558  cytochrome c-type biogenesis protein  23.42 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144138  normal  0.094009 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  37.27 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 917 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2652  cytochrome c biogenesis factor  30.26 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1414  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47005  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0582  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 222 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.149034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1191  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 262 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  28.85 
 
 		 792 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 221 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.62 
 
 		 626 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1393  tetratricopeptide TPR_4  28.04 
 
 		 232 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2362  MCP methyltransferase, CheR-type  31.76 
 
 		 478 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3248  tetratricopeptide TPR_2  26.5 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 1005 aa  43.5  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 748 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2857  cytochrome c biogenesis factor-like protein  43.18 
 
 		 258 aa  43.1  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 333 aa  43.1  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 423 aa  43.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1125  Fe-S oxidoreductase  29.41 
 
 		 555 aa  42.7  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2855  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  52.5 
 
 		 299 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20661  hypothetical protein  27.55 
 
 		 262 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  43.21 
 
 		 2262 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>