75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1351 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1351  putative cytochrome c-type biogenesis protein  100 
 
 		 426 aa  865    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.0884776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1740  putative cytochrome c-type biogenesis protein  77.7 
 
 		 426 aa  704    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000153485  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1558  cytochrome c-type biogenesis protein  77.23 
 
 		 426 aa  683    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144138  normal  0.094009 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0805  cytochrome c biogenesis factor-like protein  42.8 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3248  tetratricopeptide TPR_2  23.84 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45280  cytochrome c-type biogenesis protein  27.97 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.614364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0940  cytochrome c biogenesis factor  25.54 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0687365  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1206  hypothetical protein  24.18 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1405  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00694073  normal  0.0323168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3383  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 403 aa  88.2  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1504  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  26.21 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00909547  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3844  cytochrome c-type biogenesis protein  28.04 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0415  TPR domain-containing protein  27.01 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1952  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698376  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1395  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.22 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3645  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  24.44 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0927546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002849  cytochrome c heme lyase subunit CcmH  24.66 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0387  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.22 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03127  hypothetical protein  24.83 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  23.93 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1548  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608789  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30370  cytochrome c biogenesis protein  25.45 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2273  putative cytochrome c-type biogenesis protein precursor  24.17 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.21015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03066  putative cytochrome c-type biogenesis protein  23.7 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3888  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  24.44 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1585  cytochrome c-type biogenesis protein  23.14 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1510  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3385  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0247  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  22.88 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00131868  normal  0.0142008 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3016  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  24.83 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4773  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1637  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  25.23 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00151362  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0233  TPR repeat-containing protein  21.48 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0207631  unclonable  0.0000000000607109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0233  TPR repeat-containing protein  21.41 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00046465  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0233  tetratricopeptide domain protein  20.31 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000133281  normal  0.136922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0230  tetratricopeptide domain-containing protein  20.09 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000137712  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4022  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  20.09 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000167013  hitchhiker  0.0000372591 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1414  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47005  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0265  hypothetical protein  21.75 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0230  tetratricopeptide domain-containing protein  20.31 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000773017  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0181  TPR repeat-containing protein  21.99 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113058  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3725  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231024  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2393  TPR repeat-containing protein  21.99 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00681412  hitchhiker  0.000021772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  22.96 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4657  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  19.26 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06070  C-type cytochrome biogenesis protein  24.32 
 
 		 337 aa  57  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000967954  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00857  C-type cytochrome biogenesis protein  24.32 
 
 		 337 aa  57  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0160973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0192  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000308025  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0228  TPR repeat-containing protein  21.27 
 
 		 415 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.32958  hitchhiker  0.0059641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3772  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.291283  normal  0.0233745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1403  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  23.3 
 
 		 516 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0489784 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0217  TPR repeat-containing protein  20.82 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1038  putative cytochromre c biogenesis protein  20.16 
 
 		 432 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0895  hypothetical protein  22.67 
 
 		 228 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0633  cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  21.74 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0926  hypothetical protein  22.82 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1878  cytochrome c biogenesis factor-like  20.54 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000213055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1552  TPR repeat-containing protein  21.05 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.35552 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0938  tetratricopeptide domain-containing protein  23.29 
 
 		 360 aa  51.2  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1690  TPR repeat-containing protein  21.54 
 
 		 295 aa  50.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0640145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1372  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 298 aa  49.7  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4626  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  29.52 
 
 		 206 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.70936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4535  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  28.57 
 
 		 206 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4627  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  28.57 
 
 		 206 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4541  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  28.57 
 
 		 206 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.942267  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4676  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  28.57 
 
 		 206 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1437  cytochrome c-type biogenesis protein CycH / CcmH  23.21 
 
 		 367 aa  47  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4285  TPR repeat-containing protein  20.09 
 
 		 415 aa  46.6  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188069 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2707  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.14 
 
 		 328 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3071  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  27.14 
 
 		 366 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1655  tetratricopeptide TPR_4  21.46 
 
 		 407 aa  43.9  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3407  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>