95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2707 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2707  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 328 aa  627  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06070  C-type cytochrome biogenesis protein  44.03 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000967954  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00857  C-type cytochrome biogenesis protein  44.03 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0160973  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1585  cytochrome c-type biogenesis protein  37.23 
 
 		 400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3645  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  36.49 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0927546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1548  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608789  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45280  cytochrome c-type biogenesis protein  38.75 
 
 		 407 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.614364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3888  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  36.24 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1510  TPR repeat-containing protein  33.22 
 
 		 395 aa  99.8  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0940  cytochrome c biogenesis factor  30.69 
 
 		 427 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0687365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0415  TPR domain-containing protein  33.59 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3844  cytochrome c-type biogenesis protein  38.06 
 
 		 406 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3248  tetratricopeptide TPR_2  31.56 
 
 		 433 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1375  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  29.93 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1625  truncated C-type cytochrome biogenesis protein  36.57 
 
 		 219 aa  92  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1206  hypothetical protein  29.52 
 
 		 436 aa  92  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3016  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.77 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1405  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 399 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00694073  normal  0.0323168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  33.12 
 
 		 407 aa  89.4  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30370  cytochrome c biogenesis protein  40 
 
 		 405 aa  89.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3385  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 		 397 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1568  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1740  putative cytochrome c-type biogenesis protein  30.79 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000153485  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1878  cytochrome c biogenesis factor-like  31.6 
 
 		 418 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000213055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1558  cytochrome c-type biogenesis protein  30.16 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144138  normal  0.094009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3383  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1552  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.35552 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0387  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.69 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1504  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.27 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00909547  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1395  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.27 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0247  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  25.93 
 
 		 417 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00131868  normal  0.0142008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3772  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.291283  normal  0.0233745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1952  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  30.46 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1351  putative cytochrome c-type biogenesis protein  28.37 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.0884776 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002849  cytochrome c heme lyase subunit CcmH  27.38 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4773  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0265  hypothetical protein  25.58 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03127  hypothetical protein  28.34 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2273  putative cytochrome c-type biogenesis protein precursor  25.2 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.21015  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0233  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 415 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00046465  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0233  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0207631  unclonable  0.0000000000607109 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1372  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4285  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0228  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.32958  hitchhiker  0.0059641 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1637  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  27.55 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00151362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0181  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0217  TPR repeat-containing protein  22.74 
 
 		 417 aa  57  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270987  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3725  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231024  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1038  putative cytochromre c biogenesis protein  23.25 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0192  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 416 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000308025  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0805  cytochrome c biogenesis factor-like protein  27.01 
 
 		 471 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1655  tetratricopeptide TPR_4  31.55 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2393  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00681412  hitchhiker  0.000021772 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03066  putative cytochrome c-type biogenesis protein  23.53 
 
 		 428 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0968  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  34.32 
 
 		 412 aa  52.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0032  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 494 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.949797  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0230  tetratricopeptide domain-containing protein  25.16 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000773017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4022  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.08 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000167013  hitchhiker  0.0000372591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0230  tetratricopeptide domain-containing protein  25.08 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000137712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3071  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  26.7 
 
 		 366 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0233  tetratricopeptide domain protein  25.4 
 
 		 417 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000133281  normal  0.136922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1437  cytochrome c-type biogenesis protein CycH / CcmH  30.72 
 
 		 367 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0895  hypothetical protein  26.53 
 
 		 228 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0633  cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  30.97 
 
 		 389 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4657  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  21.9 
 
 		 416 aa  50.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855985 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0377  putative cytochrome c-type biogenesis protein  32.89 
 
 		 312 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0131086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003112  cytochrome c-type heme lyase subunit nrfG nitrite reductase complex assembly  28.21 
 
 		 207 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298519  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3450  tetratricopeptide TPR_4  30.73 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 366 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1656  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.243033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1834  tetratricopeptide TPR_2  27.04 
 
 		 367 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 878 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.21 
 
 		 643 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.13 
 
 		 810 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1690  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0640145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.22 
 
 		 733 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02729  hypothetical protein  27.18 
 
 		 207 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  30 
 
 		 661 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.89 
 
 		 2240 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 4079 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1620  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 		 1979 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  37.84 
 
 		 699 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2130  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.39 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74489  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3408  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  33.04 
 
 		 393 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1191  cytochrome c-type biogenesis protein cycH / CcmH  29.34 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 909 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 200 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 587 aa  42.7  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0281  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 504 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>