49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1028 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1028  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 448 aa  910    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000992494 
 
 
-
 
NC_002950  PG2167  immunoreactive 53 kDa antigen PG123  26.14 
 
 		 479 aa  97.4  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2679  outer membrane lipoprotein P61  25.1 
 
 		 597 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2131  60 kDa protein  26.4 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 3145 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 718 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.92 
 
 		 725 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 1421 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.8 
 
 		 743 aa  53.9  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  33.57 
 
 		 622 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 629 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 		 878 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 183 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.07 
 
 		 764 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.36 
 
 		 810 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.43 
 
 		 875 aa  50.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 632 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 748 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 750 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 311 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 934 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 313 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 716 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  35.64 
 
 		 733 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  29.07 
 
 		 632 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  29.11 
 
 		 645 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 792 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  36.56 
 
 		 1124 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 208 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  31.17 
 
 		 613 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0304  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 646 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.860081  normal  0.111747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 613 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 762 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 681 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 685 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3096  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.46 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0496806  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.85 
 
 		 645 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.88 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0337  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.85 
 
 		 265 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0957  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 161 aa  43.9  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000843973  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  24 
 
 		 561 aa  43.9  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.81 
 
 		 758 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  29.78 
 
 		 594 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  25.67 
 
 		 1677 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  27.85 
 
 		 642 aa  43.5  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 827 aa  43.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 3172 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  30.88 
 
 		 606 aa  43.1  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>