16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2167 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2167  immunoreactive 53 kDa antigen PG123  100 
 
 
479 aa  985    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2131  60 kDa protein  31.68 
 
 
490 aa  241  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1028  TPR domain-containing protein  26.14 
 
 
448 aa  97.1  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000992494 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  37.86 
 
 
218 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
454 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  27.07 
 
 
829 aa  47  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  29.87 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  31.25 
 
 
457 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  30.33 
 
 
468 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  30.17 
 
 
429 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
466 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  34.07 
 
 
335 aa  44.3  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.25 
 
 
427 aa  44.3  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  30.1 
 
 
380 aa  43.9  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  33.33 
 
 
331 aa  43.9  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  36.67 
 
 
319 aa  43.1  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>