269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1934 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 413 aa  823    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2585  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508719  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11133  TPR repeat protein  36.5 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2437  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0563701  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1681  hypothetical protein  24.9 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.09 
 
 		 2240 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.9 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  31.01 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.82 
 
 		 624 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 362 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2164  Tetratricopeptide domain protein  24.06 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal  0.621045 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 909 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.96 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.28 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  26.83 
 
 		 287 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4242  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.63 
 
 		 810 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 		 566 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 968 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3412  diguanylate cyclase with TPR repeats  27.84 
 
 		 816 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 792 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 878 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 544 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2165  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 382 aa  53.9  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0208318  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.1 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4138  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 219 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 767 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  25.21 
 
 		 266 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.26 
 
 		 599 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 739 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.94 
 
 		 816 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.9 
 
 		 1737 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 		 265 aa  53.1  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  32.41 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  32.41 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4475  TPR domain protein  32.41 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  40.28 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.43 
 
 		 561 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0006  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0006  hypothetical protein  29.13 
 
 		 293 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.38 
 
 		 573 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  32.41 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  32.41 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  32.41 
 
 		 219 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 250 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 		 677 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 465 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 762 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.43 
 
 		 561 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  32.41 
 
 		 219 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  20.95 
 
 		 573 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 697 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 927 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.39 
 
 		 725 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1676 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 274 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.27 
 
 		 1056 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3446  TPR repeat-containing protein  41.27 
 
 		 234 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 265 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3510  TPR repeat-containing protein  41.27 
 
 		 234 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.429554  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 		 873 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 219 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3364  TPR repeat-containing protein  41.27 
 
 		 234 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 515 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 557 aa  50.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 568 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1331  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.1 
 
 		 366 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 608 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1369  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.1 
 
 		 366 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1166  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.4 
 
 		 261 aa  50.1  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 505 aa  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.29 
 
 		 875 aa  50.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 597 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.8 
 
 		 1694 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 605 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  26.02 
 
 		 174 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  28.44 
 
 		 779 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.45 
 
 		 863 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2131  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 274 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  28.09 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  26.96 
 
 		 542 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 505 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.46 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 673 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1105  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0299  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 188 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.04 
 
 		 619 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 279 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1118  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.67 
 
 		 207 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.98 
 
 		 603 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  32.69 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 571 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>