13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0271 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0271  O-antigen polymerase  100 
 
 
760 aa  1524    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  25.08 
 
 
735 aa  117  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2346  O-antigen polymerase  29.25 
 
 
1009 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0470801  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1664  O-antigen polymerase  24.7 
 
 
806 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4145  O-antigen polymerase  24.29 
 
 
799 aa  71.6  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.373234  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3138  O-antigen polymerase  23.82 
 
 
761 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  25.18 
 
 
845 aa  65.1  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  24.61 
 
 
832 aa  52  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  26.09 
 
 
592 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  22.46 
 
 
612 aa  44.7  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  25.47 
 
 
592 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  25.47 
 
 
592 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  27.11 
 
 
595 aa  44.3  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>