59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0456 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  884    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  46.99 
 
 		 433 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  39.13 
 
 		 452 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  36.88 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  35.39 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  30.37 
 
 		 509 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  27.33 
 
 		 754 aa  90.5  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  27.2 
 
 		 512 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  28.28 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2985  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  30.45 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  24.18 
 
 		 785 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1503  binding-protein-dependent transport system protein  28.52 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.200132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3039  putative binding-protein-dependent transport system protein  30.66 
 
 		 341 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  23.34 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  28.31 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  27.68 
 
 		 531 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  26.71 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  26.89 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  26.79 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  23.27 
 
 		 428 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3233  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  27.8 
 
 		 474 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1029  putative O-antigen polymerase, putative membrane protein  27.97 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.384191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  22.46 
 
 		 930 aa  53.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  23.62 
 
 		 597 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3781  O-antigen polymerase  24.53 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  30.94 
 
 		 402 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3440  O-antigen polymerase  23.13 
 
 		 508 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2494  O-antigen polymerase  28.27 
 
 		 563 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.754605 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  26.69 
 
 		 467 aa  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  22.72 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  23.16 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  22.72 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  25.83 
 
 		 832 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  29.76 
 
 		 668 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  30.08 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  26.79 
 
 		 501 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  27.03 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  27.03 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  27.03 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  25.28 
 
 		 561 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  29.25 
 
 		 565 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  26.34 
 
 		 605 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  27.91 
 
 		 594 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  29.13 
 
 		 544 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  22.77 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  25 
 
 		 504 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  23.7 
 
 		 737 aa  45.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3244  O-antigen polymerase  30.48 
 
 		 501 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3247  O-antigen polymerase  26.29 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  25.21 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  26.98 
 
 		 540 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  22.41 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  23.97 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2694  O-antigen polymerase  30.34 
 
 		 535 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  25.18 
 
 		 431 aa  44.3  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  22.17 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  22.83 
 
 		 440 aa  43.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  20.39 
 
 		 503 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  23.15 
 
 		 502 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>