15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3440 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3440  O-antigen polymerase  100 
 
 		 508 aa  1012    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  28.75 
 
 		 489 aa  99.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  23.95 
 
 		 433 aa  76.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  26.55 
 
 		 754 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  23.89 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  24.16 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  21.93 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  26.22 
 
 		 930 aa  57  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  28.24 
 
 		 402 aa  53.5  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3039  putative binding-protein-dependent transport system protein  28.79 
 
 		 341 aa  52  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0690  hypothetical protein  26.13 
 
 		 458 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  26.48 
 
 		 472 aa  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1492  hypothetical protein  25.65 
 
 		 468 aa  50.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  23.68 
 
 		 470 aa  48.5  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3244  O-antigen polymerase  41.25 
 
 		 501 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.922939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>