13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2494 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2494  O-antigen polymerase  100 
 
 
563 aa  1119    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.754605 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0198  O-antigen polymerase  24.69 
 
 
874 aa  65.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  25.76 
 
 
737 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  25.4 
 
 
589 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  26.42 
 
 
612 aa  51.6  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  24.66 
 
 
470 aa  50.4  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  28.57 
 
 
438 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
605 aa  47.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  41.67 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0122  O-antigen polymerase  22.81 
 
 
1065 aa  46.2  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  25.61 
 
 
464 aa  44.3  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  23.39 
 
 
773 aa  44.3  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  28.29 
 
 
754 aa  43.9  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>