83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4434 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  100 
 
 		 474 aa  942    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  41.43 
 
 		 504 aa  296  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  41.92 
 
 		 503 aa  289  6e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  35.59 
 
 		 496 aa  247  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  30.21 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  27.16 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  26.84 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  26.26 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  27.55 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  26.13 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  29.7 
 
 		 498 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  24.48 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  27.21 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  26.07 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  24.4 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  24.05 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  22.62 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  27.88 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  28.03 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0850  hypothetical protein  27.53 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0783552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  30.56 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.61 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  27.81 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  25 
 
 		 500 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  32.1 
 
 		 1025 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  25.4 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  31.73 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  25.26 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  27.24 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  24.6 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  27.62 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  24.54 
 
 		 458 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  24.32 
 
 		 467 aa  54.3  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  24.45 
 
 		 504 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  23.62 
 
 		 540 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  25.99 
 
 		 512 aa  53.9  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  22.67 
 
 		 454 aa  53.5  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  23.23 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  31.39 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0980  hypothetical protein  27.54 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  23.76 
 
 		 425 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  24.41 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  23.94 
 
 		 413 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  25.22 
 
 		 461 aa  50.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  23.84 
 
 		 416 aa  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2808  O-antigen polymerase  21.35 
 
 		 494 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3347  O-antigen polymerase  30.83 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  21.63 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  22.01 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  27.71 
 
 		 497 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0861  O-antigen polymerase  26.35 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  25.51 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  24.51 
 
 		 492 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2653  O-antigen polymerase  27.17 
 
 		 499 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  26.01 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1013  hypothetical protein  23.56 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  29.01 
 
 		 754 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  22.26 
 
 		 404 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  21.89 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  27.19 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  23.18 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  23.08 
 
 		 537 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  25.66 
 
 		 402 aa  47.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  24.63 
 
 		 404 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  29.71 
 
 		 443 aa  47.4  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  24.63 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  24.63 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  24.63 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  35.16 
 
 		 686 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  32.05 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  32.05 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  35.16 
 
 		 686 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  29.71 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4026  O-antigen polymerase  30.22 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  34.41 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1116  hypothetical protein  24.15 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.048386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  22.95 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5061  hypothetical protein  24.36 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  30.49 
 
 		 671 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  31.58 
 
 		 894 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5482  hypothetical protein  26.67 
 
 		 545 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3375  O-antigen polymerase  23.2 
 
 		 432 aa  43.5  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221665  normal  0.11504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>