21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1013 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1013  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  808    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1116  hypothetical protein  89.83 
 
 		 413 aa  689    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.048386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5061  hypothetical protein  77.78 
 
 		 418 aa  639    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4438  hypothetical protein  74.51 
 
 		 414 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1411  hypothetical protein  57.82 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2467  hypothetical protein  58.88 
 
 		 421 aa  448  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4608  hypothetical protein  57.83 
 
 		 423 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0662685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2510  hypothetical protein  35.21 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27488  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0850  hypothetical protein  35.82 
 
 		 426 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0783552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1662  hypothetical protein  33.88 
 
 		 408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2117  hypothetical protein  33.7 
 
 		 478 aa  216  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1781  hypothetical protein  34.69 
 
 		 487 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.907902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1309  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.42 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1729  hypothetical protein  34.15 
 
 		 486 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0818924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1221  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.33 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2648  hypothetical protein  34.96 
 
 		 419 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1153  hypothetical protein  34.96 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3684  O-antigen polymerase  32.52 
 
 		 424 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3002  hypothetical protein  34.33 
 
 		 441 aa  186  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4936  hypothetical protein  32.65 
 
 		 421 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  25.77 
 
 		 440 aa  43.9  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>